RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000116376.8

Sh3bp5l-202, Transcript of SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp5l, Length 3,016 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Cep55Q8BT07 462 aa14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Pcdhb22Q91XZ8 794 aa14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Riok1Q922Q2 567 aa14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 TrhQ62361 256 aa14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 U2af1l4Q8BGJ9 220 aa14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Q8BZJ8 459 aa14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Ccdc94Q9D6J3 314 aa14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Lrp6O88572 1613 aa14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Ltbp4Q8K4G1 1666 aa14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Gm28047Q3US59 414 aa14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Zfp251Q6PCX8 632 aa14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Zkscan8Q8BSL0 588 aa14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Tpcn2Q8BWC0 731 aa14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Sox30Q8CGW4 782 aa14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Kcnk13Q8R1P5 405 aa14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Mei1Q9D4I2 1268 aa14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Kndc1Q0KK55 1742 aa14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Lrrc8aQ80WG5 810 aa14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Ift57Q8BXG3 429 aa14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Nop2Q922K7 793 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Dhx30Q99PU8 1217 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Ccer1Q9CQL2 403 aa14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Rcan1Q9JHG6 198 aa14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Gm43638A0A0J9YU36 694 aa14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Zkscan4Q5SZT6 480 aa14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Ano6Q6P9J9 911 aa14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Tmem87aQ8BXN9 555 aa14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Gpr108Q91WD0 569 aa14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Trim30aP15533 496 aa14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Fkbp1aP26883 108 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Gpr182P43142 395 aa14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Atp2b3Q0VF55 1220 aa14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Atp1a3Q6PIC6 1013 aa14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Cap2Q9CYT6 476 aa14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 FAM186AQ9D9R9 1790 aa14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Ccne2Q9Z238 404 aa14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Gm20425E9Q035 978 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 SrprbP47758 269 aa14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Smg7Q5RJH6 1138 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Slu7Q8BHJ9 585 aa14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 SdsQ8VBT2 327 aa14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Cfap44E9Q5M6 1843 aa14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Ankrd31A0A140LI88 1765 aa14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Ssc5dQ8BV57 1371 aa14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Cyp3a59D3Z2W7 503 aa14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 FosbP13346 338 aa14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 CpdO89001 1377 aa14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 MetP16056 1379 aa14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Atp2b1G5E829 1220 aa14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Prl3d1P18121 224 aa14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Sass6Q80UK7 654 aa14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Odf2lQ9D478 642 aa14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Rgs12Q8CGE9 1381 aa14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Kcnh4A2A5F7 1018 aa14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Sptlc2P97363 560 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Brinp3Q499E0 766 aa14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Hand2Q61039 217 aa14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Edrf1Q6GQV7 1239 aa14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Golph3lQ8R088 285 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Clic4Q9QYB1 253 aa14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Lama4P97927 1816 aa14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Myh1Q5SX40 1942 aa14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Akap11E9Q777 1895 aa14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Znf326O88291 580 aa14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Ccnl1Q52KE7 532 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Fsd2Q8BZ52 692 aa14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Stk38Q91VJ4 465 aa14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Fam84aQ9D650 292 aa14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Zbtb38Q3LR78 1197 aa14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Nlrp9aQ66X03 949 aa14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 IncenpQ9WU62 880 aa14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Dhx8A2A4P0 1244 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Pcdhb9E9Q5G2 828 aa14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 XpcP51612 930 aa14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Ube2oQ6ZPJ3 1288 aa14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Nme8Q715T0 586 aa14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Abtb2Q7TQI7 1024 aa14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Serpina10Q8R121 448 aa14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Acsbg1Q99PU5 721 aa14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Ankrd1Q9CR42 319 aa14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Setdb1O88974 1307 aa14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Pramel3A2AHA7 463 aa14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Gm7903A2AWL1 463 aa14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 AV320801A2AWL3 467 aa14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Gm15023L7MUB4 467 aa14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Casp12O08736 419 aa14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Sept1P42209 366 aa14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Nxf2Q4ZGD8 691 aa14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Dync1i1O88485 628 aa14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Anks1aP59672 1150 aa14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Plbd2Q3TCN2 594 aa14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Cdkl5Q3UTQ8 938 aa14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 VmacQ8BP01 174 aa14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 CrebrfQ8CDG5 640 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Cnot6lQ8VEG6 555 aa14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Creld2Q9CYA0 350 aa14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Cyp2d9P11714 504 aa14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Itga6Q61739 1091 aa14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 IqcgQ80W32 419 aa14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37 ms