RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586397.5

PRKAR1A-211, Transcript of protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKAR1A, Length 1,940 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1A-211ENST00000586397 SLC6A1P30531 599 aa7.51□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 UQCRFS1P47985 274 aa7.51□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 NPBWR2P48146 333 aa7.51□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 PCGF3Q3KNV8 242 aa7.51□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 PIGYQ3MUY2 71 aa7.51□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 OLFML2AQ68BL7 652 aa7.51□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 Q8IYB0 196 aa7.51□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 C9orf62Q8N4C0 152 aa7.51□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 MMP28Q9H239 520 aa7.51□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 IFT22Q9H7X7 185 aa7.51□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 MSL2Q9HCI7 577 aa7.51□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 MED9Q9NWA0 146 aa7.51□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 UBQLN2Q9UHD9 624 aa7.51□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 DUSP13Q9UII6 198 aa7.51□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 HSF4Q9ULV5 492 aa7.51□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 ST3GAL6Q9Y274 331 aa7.51□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 KCNK7Q9Y2U2 307 aa7.51□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 CADP27708 2225 aa7.51□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 PLSCR5A0PG75 271 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 KRBOX1C9JBD0 128 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 H0YL77 283 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 PF4P02776 101 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 RRASP10301 218 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 ZP3P21754 424 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 BTCP35070 178 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 FAUP35544 74 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 KIR2DL3P43628 341 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 TFF3Q07654 80 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 CDSNQ15517 529 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 TAF9Q16594 264 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 NCMAPQ5T1S8 102 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 SHEQ5VZ18 495 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 TMEM65Q6PI78 240 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 LINC00596Q86U02 117 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 LRP11Q86VZ4 500 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 SCCPDHQ8NBX0 429 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 ZNF680Q8NEM1 530 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 ST8SIA4Q92187 359 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 SYT3Q9BQG1 590 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 PECRQ9BY49 303 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 TLNRD1Q9H1K6 362 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 HRASLSQ9HDD0 168 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 ESPL1Q14674 2120 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 CACNA1BQ00975 2339 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 MEIS3P1A6NDR6 274 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 F5H5P2 479 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 H3BUI4 141 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 PDCD6O75340 191 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 CHATP28329 748 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 GRNP28799 593 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 CD200P41217 278 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 TAS2R19P59542 299 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 IL13RA2Q14627 380 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 AANATQ16613 207 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 MPV17LQ2QL34 196 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 PLA1AQ53H76 456 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 ADAM5Q6NVV9 412 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 RTN4RL2Q86UN3 420 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 COMMD7Q86VX2 200 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 OR8H3Q8N146 312 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 TMEM229BQ8NBD8 167 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 OR5T2Q8NGG2 359 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 DPAGT1Q9H3H5 408 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 IFT46Q9NQC8 304 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 COPZ2Q9P299 210 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 SLC23A1Q9UHI7 598 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 KIF25Q9UIL4 384 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 ANAPC10Q9UM13 185 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 ALG5Q9Y673 324 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 ATP23Q9Y6H3 246 aa7.5□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 F8VVB4 439 aa7.49□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 F8VWA3 439 aa7.49□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 CDIPTO14735 213 aa7.49□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 TSPAN4O14817 238 aa7.49□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 SSX5O60225 188 aa7.49□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 RHBDL1O75783 438 aa7.49□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 MT-ND4P03905 459 aa7.49□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 GRPP07492 148 aa7.49□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 AKAIN1P0CW23 69 aa7.49□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 PGA5P0DJD9 388 aa7.49□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 PMELP40967 661 aa7.49□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 ARFRP1Q13795 201 aa7.49□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 ADIPOQQ15848 244 aa7.49□□□□□ -1.21
PRKAR1A-211ENST00000586397 IGFBP7Q16270 282 aa7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms