RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358355.5

USP20-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP20, Length 4,371 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-202ENST00000358355 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa11.3□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 NOTCH4Q99466 2003 aa11.3□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 IRF3Q14653 427 aa11.3□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 BTNL3Q6UXE8 466 aa11.3□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 GLCCI1Q86VQ1 547 aa11.3□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 MED9Q9NWA0 146 aa11.3□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 IL36GQ9NZH8 169 aa11.3□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 SCN2AQ99250 2005 aa11.3□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 MGST1P10620 155 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 TGM1P22735 817 aa11.3□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 CEBPEQ15744 281 aa11.3□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 ADIRFQ15847 76 aa11.3□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 PXDC1Q5TGL8 231 aa11.3□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 FAM122BQ7Z309 247 aa11.3□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 ZNF485Q8NCK3 441 aa11.3□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 DSPPQ9NZW4 1301 aa11.3□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 TMEM11P17152 192 aa11.29□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 TOR2AQ5JU69 321 aa11.29□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 TMEM171Q8WVE6 324 aa11.29□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 PECRQ9BY49 303 aa11.29□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 OR2J1Q9GZK6 312 aa11.29□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 MSL2Q9HCI7 577 aa11.29□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 RASL12Q9NYN1 266 aa11.29□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 KCNE5Q9UJ90 142 aa11.29□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa11.29□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 NUDT19A8MXV4 375 aa11.29□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 K7ESF4 209 aa11.29□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 CST7O76096 145 aa11.29□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 SEMG1P04279 462 aa11.29□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 GGTLC2Q14390 218 aa11.29□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 AP1S3Q96PC3 154 aa11.29□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 HES4Q9HCC6 221 aa11.29□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 GDF9O60383 454 aa11.29□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 M6PRP20645 277 aa11.29□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 LPAR6P43657 344 aa11.29□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 RAB5CP51148 216 aa11.29□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 PDZK1IP1Q13113 114 aa11.29□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 ZPLD1Q8TCW7 415 aa11.29□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 SAMD10Q9BYL1 202 aa11.29□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 RAB18Q9NP72 206 aa11.29□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 CACNA1DQ01668 2161 aa11.29□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 BRCA2P51587 3418 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 SSX4O60224 188 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 IGF2P01344 180 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 MGAT2Q10469 447 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 OR2D2Q9H210 308 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 GPR27Q9NS67 375 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 RNF24Q9Y225 148 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 KPTNQ9Y664 436 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 A0A0U1RQV5 110 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 TMEM210A6NLX4 147 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 SOCS1O15524 211 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 HAND1O96004 215 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 OR2B8PP59922 312 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 PSG4Q00888 419 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 PPP1R1AQ13522 171 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 GVQW1Q8N7I0 195 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 OR8B3Q8NGG8 313 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 AKR1E2Q96JD6 320 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 OR8B2Q96RD0 313 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 GNG13Q9P2W3 67 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 PI4KAP42356 2102 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 NME2P1O60361 137 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 SFT2D2O95562 160 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 CRYZL1O95825 349 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 IGHV3-43DP0DP04 118 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 RAB40CQ96S21 281 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 SOX7Q9BT81 388 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 NMES1Q9C002 83 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 NAA60Q9H7X0 242 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 FOXJ2Q9P0K8 574 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 TTRP02766 147 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 CD37P11049 281 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 BTN1A1Q13410 526 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 MOB3AQ96BX8 217 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 ACY3Q96HD9 319 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 KCNK17Q96T54 332 aa11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa11.27□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 CLN5O75503 358 aa11.27□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 CRYBA1P05813 215 aa11.27□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 IL11P20809 199 aa11.27□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 TIGITQ495A1 244 aa11.27□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 APCDD1LQ8NCL9 501 aa11.27□□□□□ -0.6
USP20-202ENST00000358355 VSTM2AQ8TAG5 236 aa11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.2 ms