RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592911.5

SMAD4-215, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 5

Gene SMAD4, Length 475 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-215ENST00000592911 RRM2P31350 389 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD4-215ENST00000592911 NUDT2P50583 147 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD4-215ENST00000592911 PRRX1P54821 245 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD4-215ENST00000592911 EDDM3BP56851 147 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD4-215ENST00000592911 FHL3Q13643 280 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD4-215ENST00000592911 CEP78Q5JTW2 689 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD4-215ENST00000592911 SLC35D3Q5M8T2 416 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD4-215ENST00000592911 CLVS2Q5SYC1 327 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD4-215ENST00000592911 GLYATQ6IB77 296 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD4-215ENST00000592911 Q6ZSR3 168 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD4-215ENST00000592911 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD4-215ENST00000592911 DRAM1Q8N682 238 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD4-215ENST00000592911 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
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SMAD4-215ENST00000592911 CORO2AQ92828 525 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD4-215ENST00000592911 ISOC1Q96CN7 298 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD4-215ENST00000592911 DGCR6LQ9BY27 220 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD4-215ENST00000592911 MYLK2Q9H1R3 596 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD4-215ENST00000592911 EGLN3Q9H6Z9 239 aa6.86□□□□□ -1.31
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SMAD4-215ENST00000592911 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
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SMAD4-215ENST00000592911 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
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SMAD4-215ENST00000592911 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
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SMAD4-215ENST00000592911 FAM27D1Q5T7N8 215 aa6.85□□□□□ -1.31
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SMAD4-215ENST00000592911 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-215ENST00000592911 C10orf99Q6UWK7 81 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-215ENST00000592911 OR8H3Q8N146 312 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-215ENST00000592911 STPG2Q8N412 459 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-215ENST00000592911 RNF148Q8N7C7 305 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-215ENST00000592911 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.84□□□□□ -1.31
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SMAD4-215ENST00000592911 ASB17Q8WXJ9 295 aa6.84□□□□□ -1.31
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SMAD4-215ENST00000592911 CEP19Q96LK0 163 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-215ENST00000592911 AMELYQ99218 206 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-215ENST00000592911 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-215ENST00000592911 BTBD10Q9BSF8 475 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-215ENST00000592911 YIPF3Q9GZM5 350 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-215ENST00000592911 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-215ENST00000592911 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-215ENST00000592911 PIGLQ9Y2B2 252 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-215ENST00000592911 SERPINE3A8MV23 424 aa6.83□□□□□ -1.32
SMAD4-215ENST00000592911 A8MZ25 164 aa6.83□□□□□ -1.32
SMAD4-215ENST00000592911 TOR1AO14656 332 aa6.83□□□□□ -1.32
SMAD4-215ENST00000592911 CCDC22O60826 627 aa6.83□□□□□ -1.32
SMAD4-215ENST00000592911 GATBO75879 557 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SMAD4-215ENST00000592911 CCNB2O95067 398 aa6.83□□□□□ -1.32
SMAD4-215ENST00000592911 CSN2P05814 226 aa6.83□□□□□ -1.32
SMAD4-215ENST00000592911 OR8U8P0C7N1 319 aa6.83□□□□□ -1.32
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