RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 APOL4Q9BPW4 351 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 RGCCQ9H4X1 137 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 VCX3AQ9NNX9 186 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 CMC2Q9NRP2 79 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 FAM118AQ9NWS6 357 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 BLOC1S6Q9UL45 172 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 TCF19Q9Y242 345 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 A0A087WXM4 84 aa5.25□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa5.25□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa5.25□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1W2PRX2 142 aa5.25□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 ODF3BA8MYP8 253 aa5.25□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 SYNGR1O43759 233 aa5.25□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 APOC1P02654 83 aa5.25□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 PRKACGP22612 351 aa5.25□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 CAPZA1P52907 286 aa5.25□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 RPL31P62899 125 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 GNG3P63215 75 aa5.25□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 APOFQ13790 326 aa5.25□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 CEACAM21Q3KPI0 293 aa5.25□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 KCTD21Q4G0X4 260 aa5.25□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 SHFQ7M4L6 423 aa5.25□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 POC1AQ8NBT0 407 aa5.25□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 OR2T33Q8NG76 320 aa5.25□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 OR2T27Q8NH04 317 aa5.25□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 OTOSQ8NHW6 89 aa5.25□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 THEM6Q8WUY1 208 aa5.25□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 TSC22D3Q99576 134 aa5.25□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 DGCR6LQ9BY27 220 aa5.25□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa5.25□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 OR51V1Q9H2C8 321 aa5.25□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa5.25□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 RAB18Q9NP72 206 aa5.25□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 ABCB9Q9NP78 766 aa5.25□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 KRT84Q9NSB2 600 aa5.25□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 FAM206AQ9NX38 181 aa5.25□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 BAIAP2Q9UQB8 552 aa5.25□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 LRP12Q9Y561 859 aa5.25□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa5.25□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa5.25□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 RIIAD1A6NNX1 92 aa5.24□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 C17orf98A8MV24 154 aa5.24□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 PSMD9O00233 223 aa5.24□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 SLC16A6O15403 523 aa5.24□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 IGLV3-1P01715 115 aa5.24□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 GNAO1P09471 354 aa5.24□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 PIPP12273 146 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 ATP6V1B1P15313 513 aa5.24□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 FAHP16930 419 aa5.24□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF3P17036 446 aa5.24□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 PRDX2P32119 198 aa5.24□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 ALDH3B2P48448 385 aa5.24□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 BLVRAP53004 296 aa5.24□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 CD83Q01151 205 aa5.24□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 SSX2Q16385 188 aa5.24□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 MICAQ29983 383 aa5.24□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 KDM4DQ6B0I6 523 aa5.24□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 PLBD1Q6P4A8 553 aa5.24□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 C10orf99Q6UWK7 81 aa5.24□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 MOB3CQ70IA8 216 aa5.24□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 TCF23Q7RTU1 214 aa5.24□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 BBS1Q8NFJ9 593 aa5.24□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 OR4F17Q8NGA8 305 aa5.24□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 OR5A2Q8NGI9 324 aa5.24□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 OTULINQ96BN8 352 aa5.24□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 OR4F4Q96R69 305 aa5.24□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 OR8B4Q96RC9 309 aa5.24□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 YIPF3Q9GZM5 350 aa5.24□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 RIBC2Q9H4K1 309 aa5.24□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 SCN3BQ9NY72 215 aa5.24□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC160A6NGH7 325 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 IFNGP01579 166 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 TK1P04183 234 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 ARG1P05089 322 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 PGA5P0DJD9 388 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 ALOX5APP20292 161 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 SLC2A5P22732 501 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 DAPP51397 102 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 LGALS4P56470 323 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 CNPY1Q3B7I2 92 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 PLCXD3Q63HM9 321 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF626Q68DY1 528 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 FAHD1Q6P587 224 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 CD300LDQ6UXZ3 194 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 HS3ST5Q8IZT8 346 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 FTMTQ8N4E7 242 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF561Q8N587 486 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 OR10G2Q8NGC3 310 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF671Q8TAW3 534 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 TEAD3Q99594 435 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 NRIP2Q9BQI9 281 aa5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.5 ms