RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 GNGT2O14610 69 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARPC3O15145 178 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 SURF4O15260 269 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 FOXH1O75593 365 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 IFNGP01579 166 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 TFF1P04155 84 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 CD55P08174 381 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 T-ENOLP0DO92 83 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 FCGR1AP12314 374 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 IRF2P14316 349 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 MDH2P40926 338 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 PITPNBP48739 271 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 SRP9P49458 86 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 THBS3P49746 956 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 RGS6P49758 472 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAD23AP54725 363 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 GNB2P62879 340 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 HIST1H3AP68431 136 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 FLOT2Q14254 428 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR8B8Q15620 311 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 DMRTC1Q5HYR2 192 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 LIPNQ5VXI9 398 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM236Q5W0B7 351 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLBD1Q6P4A8 553 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 LYPD2Q6UXB3 125 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 FBXW12Q6X9E4 464 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 BRD3OSQ6XYD6 125 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF826PQ6ZT77 177 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 HIST2H3AQ71DI3 136 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 PGAP1Q75T13 922 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 COMMD2Q86X83 199 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDZD9Q8IXQ8 264 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 BATF2Q8N1L9 274 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 PARP8Q8N3A8 854 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 FGFRL1Q8N441 504 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 LINC00471Q8N535 108 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 DEFB108BQ8NET1 73 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 BBS1Q8NFJ9 593 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR8G5Q8NG78 346 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR5L1Q8NGL2 311 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR13G1Q8NGZ3 307 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR2T4Q8NH00 348 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR8S1Q8NH09 359 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR5R1Q8NH85 324 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 CANT1Q8WVQ1 401 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLAMF6Q96DU3 332 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 ASB9Q96DX5 294 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 NSL1Q96IY1 281 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 INTS14Q96SY0 518 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 FEVQ99581 238 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC30A2Q9BRI3 323 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 TEX12Q9BXU0 123 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR51V1Q9H2C8 321 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 CTSZQ9UBR2 303 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 IL19Q9UHD0 177 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 OPN4Q9UHM6 478 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATPIF1Q9UII2 106 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLHL21Q9UJP4 597 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa3.65□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRRC30A6NM36 301 aa3.65□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 CD300LBA8K4G0 201 aa3.65□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 H3BSH0 61 aa3.65□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 DYNC1I1O14576 645 aa3.65□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 GYG2O15488 501 aa3.65□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADAM20O43506 726 aa3.65□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRT36O76013 467 aa3.65□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 GYPAP02724 150 aa3.65□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 SFTPBP07988 381 aa3.65□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANPEPP15144 967 aa3.65□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 PAICSP22234 425 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRKACGP22612 351 aa3.65□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 FMO3P31513 532 aa3.65□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 PMELP40967 661 aa3.65□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 MNAT1P51948 309 aa3.65□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 DLX1P56177 255 aa3.65□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 HILS1P60008 231 aa3.65□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 CBX1P83916 185 aa3.65□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF154Q13106 437 aa3.65□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 SCGB2A2Q13296 93 aa3.65□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAB21L1Q13394 359 aa3.65□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 MICAQ29983 383 aa3.65□□□□□ -1.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.1 ms