RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	9.38	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		9.38	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246		Q6ZSR3	168 aa		9.38	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	UTS2B	Q765I0	119 aa		9.38	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		9.38	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		9.38	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		9.38	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	9.38	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	9.38	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	FGGY	Q96C11	551 aa		9.38	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	SDSL	Q96GA7	329 aa		9.38	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	OPALIN	Q96PE5	141 aa		9.38	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	GAFA1	Q96PS6	74 aa		9.38	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		9.38	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	VCX3B	Q9H321	246 aa		9.38	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		9.38	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		9.38	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	9.38	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	AMBN	Q9NP70	447 aa		9.38	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		9.38	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	9.38	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		9.38	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	FUOM	A2VDF0	154 aa		9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246		H3BUI4	141 aa		9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	CLDN34	H7C241	214 aa		9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	IGHV1-69	P01742	117 aa		9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	SFTPB	P07988	381 aa		9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	FBP1	P09467	338 aa		9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	MPZ	P25189	248 aa		9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	POU3F4	P49335	361 aa		9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	BMX	P51813	675 aa		9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	LGALS4	P56470	323 aa		9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	ISL1	P61371	349 aa		9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	DGUOK	Q16854	277 aa		9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC58	Q4VC31	144 aa		9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	RDH10	Q8IZV5	341 aa		9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM86B	Q8N661	226 aa		9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	GPER1	Q99527	375 aa		9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	S100A13	Q99584	98 aa		9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	RHOF	Q9HBH0	211 aa		9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	COL6A5	A8TX70	2615 aa		9.37	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246		H0YHG0	523 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246		J3QRE1	110 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	SYNGR1	O43759	233 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	IGHA1	P01876	353 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	GABRB1	P18505	474 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	PEX2	P28328	305 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	KIR3DL2	P43630	455 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP3R1	P63098	170 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	UBE2V2	Q15819	145 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF691	Q5VV52	312 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	STX19	Q8N4C7	294 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	SLAMF9	Q96A28	289 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	SEH1L	Q96EE3	360 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	PELI1	Q96FA3	418 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM80	Q96HE8	168 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	SIRPD	Q9H106	197 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	CKLF	Q9UBR5	152 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A1B0GUS0	222 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM89	A2RUT3	159 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	SH2D1B	O14796	132 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	MYL12B	O14950	172 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	INMT	O95050	263 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TTLL3-231	ENST00000496246	RAB3A	P20336	220 aa		9.35	□□□□□ -0.91

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