RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495748.5

PTPRK-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 746 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-214ENST00000495748 DNAL1Q4LDG9 190 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 SLX4IPQ5VYV7 408 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 CRIP3Q6Q6R5 217 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 ASRGL1Q7L266 308 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 GDPD3Q7L5L3 318 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 Q8IYB0 196 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 ENTHD1Q8IYW4 607 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 ELMOD2Q8IZ81 293 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 CCDC197Q8NCU1 140 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 BBS1Q8NFJ9 593 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 OR4M1Q8NGD0 313 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 PPP1R35Q8TAP8 253 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 C17orf50Q8WW18 174 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 CAPSLQ8WWF8 208 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 AKR1E2Q96JD6 320 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 NRIP2Q9BQI9 281 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 ADI1Q9BV57 179 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 GPR173Q9NS66 373 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 GLS2Q9UI32 602 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 FOXJ3Q9UPW0 622 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 SLC22A13Q9Y226 551 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 TCF19Q9Y242 345 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 SIGLEC9Q9Y336 463 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 R4GMQ9 66 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 V9GYS6 101 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 PLXNB1O43157 2135 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 hADV38S2A0JD32 116 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 PQLC2LA1A4F0 135 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 FUOMA2VDF0 154 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 G3V4G9 280 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 PSMD9O00233 223 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 F2RL2O00254 374 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 SYNGR1O43759 233 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 CYB5AP00167 134 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 TTRP02766 147 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 TFF1P04155 84 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 KRT8P05787 483 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 CCL3L1P16619 93 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 DYNLT3P51808 116 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 BMXP51813 675 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 FUT6P51993 359 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 HCCSP53701 268 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 EDDM3BP56851 147 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 LOXL3P58215 753 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 CXCR4P61073 352 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 IL24Q13007 206 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 FLOT2Q14254 428 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 MINOS1Q5TGZ0 78 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 NXNL2Q5VZ03 156 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 TMEM42Q69YG0 159 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 SPATA24Q86W54 205 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 GID4Q8IVV7 300 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 SLC35F2Q8IXU6 374 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 Q8N2B8 174 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 OR11H6Q8NGC7 330 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 SGCDQ92629 289 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 R3HDM4Q96D70 268 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 SNX22Q96L94 193 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 ZNF714Q96N38 554 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 THTPAQ9BU02 230 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 HES4Q9HCC6 221 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 NECAP2Q9NVZ3 263 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 CLN6Q9NWW5 311 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 TAS2R1Q9NYW7 299 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 OR52A1Q9UKL2 312 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 MEGF11A6BM72 1044 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 A6NDX4 124 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 ODF3BA8MYP8 253 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 SYT7O43581 403 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 CHST1O43916 411 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 FKBP6O75344 327 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 ALX3O95076 343 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 IGHV1-8P0DP01 117 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 PIPP12273 146 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 PRKACGP22612 351 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 PEX2P28328 305 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 BRS3P32247 399 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 COL10A1Q03692 680 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 ZNF273Q14593 569 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 SSX2Q16385 188 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-214ENST00000495748 TMEM236Q5W0B7 351 aa6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.5 ms