RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	8.71	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	USE1	Q9NZ43	259 aa		8.71	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		8.71	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		8.71	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511		U3KQK5	164 aa		8.71	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511		A6NDX4	124 aa		8.7	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		8.7	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	VGLL3	A8MV65	326 aa		8.7	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	IDH3B	O43837	385 aa		8.7	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	APOC1	P02654	83 aa		8.7	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	ARG1	P05089	322 aa		8.7	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	8.7	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	RHCE	P18577	417 aa		8.7	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	FMO3	P31513	532 aa		8.7	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	ENTPD1	P49961	510 aa		8.7	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	8.7	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	BLCAP	P62952	87 aa		8.7	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	MXRA7	P84157	204 aa		8.7	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	8.7	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	SEC23B	Q15437	767 aa		8.7	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		8.7	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		8.7	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		8.7	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		8.7	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		8.7	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		8.7	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	PIGC	Q92535	297 aa		8.7	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	SGK3	Q96BR1	496 aa		8.7	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	OR10A2	Q9H208	303 aa		8.7	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	YY1AP1	Q9H869	796 aa		8.7	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	ABCB9	Q9NP78	766 aa		8.7	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		8.7	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		8.69	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		8.69	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	C3orf84	H3BNL1	204 aa		8.69	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC1A7	O00341	560 aa		8.69	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	8.69	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	DIRAS1	O95057	198 aa		8.69	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	CHRM2	P08172	466 aa		8.69	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	PSG2	P11465	335 aa		8.69	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	LMO1	P25800	156 aa		8.69	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	IFNGR2	P38484	337 aa		8.69	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC25A1	P53007	311 aa		8.69	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	OR12D2	P58182	307 aa		8.69	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	SMIM11A	P58511	58 aa		8.69	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	CBX1	P83916	185 aa		8.69	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC34A1	Q06495	639 aa		8.69	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	KLF10	Q13118	480 aa		8.69	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	8.69	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		8.69	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		8.69	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		8.69	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		8.69	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		8.69	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2T27	Q8NH04	317 aa		8.69	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	8.69	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		8.69	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	MYDGF	Q969H8	173 aa		8.69	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	C16orf92	Q96LL3	132 aa		8.69	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	C8orf49	Q96NF6	230 aa		8.69	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		8.69	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	CMTM6	Q9NX76	183 aa		8.69	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		8.69	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	8.69	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	8.69	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	8.69	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	LRP12	Q9Y561	859 aa		8.69	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	COL7A1	Q02388	2944 aa		8.68	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	RHBDL1	O75783	438 aa		8.68	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	GADD45G	O95257	159 aa		8.68	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC159	P0C7I6	412 aa		8.68	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	8.68	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	NCK1	P16333	377 aa		8.68	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	CCL3L1	P16619	93 aa		8.68	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	GPM6A	P51674	278 aa		8.68	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	8.68	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	COL10A1	Q03692	680 aa		8.68	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		8.68	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		8.68	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		8.68	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		8.68	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		8.68	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		8.68	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	RCN3	Q96D15	328 aa		8.68	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	MALSU1	Q96EH3	234 aa		8.68	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		8.68	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF649	Q9BS31	505 aa		8.68	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	RGCC	Q9H4X1	137 aa		8.68	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		8.68	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	DHRS12	A0PJE2	317 aa		8.67	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		8.67	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	8.67	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	GMNN	O75496	209 aa		8.67	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	PSKH1	P11801	424 aa		8.67	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	NUDT2	P50583	147 aa		8.67	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	8.67	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		8.67	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	8.67	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		8.67	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	NDNF	Q8TB73	568 aa		8.67	□□□□□ -1.02

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