RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-208ENST00000547298 H3BUI4 141 aa8.81□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 ZNF728P0DKX0 622 aa8.81□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 ACKR3P25106 362 aa8.81□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 STX1BP61266 288 aa8.81□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 ACTA2P62736 377 aa8.81□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 ACTG2P63267 376 aa8.81□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 ACTC1P68032 377 aa8.81□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 ACTA1P68133 377 aa8.81□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 IFFO1Q0D2I5 559 aa8.81□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 AGKQ53H12 422 aa8.81□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 LYPD4Q6UWN0 246 aa8.81□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 ZNF730Q6ZMV8 503 aa8.81□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa8.81□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 ACP7Q6ZNF0 438 aa8.81□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 LINC00471Q8N535 108 aa8.81□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 ZNF561Q8N587 486 aa8.81□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 NDNFQ8TB73 568 aa8.81□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 RNF170Q96K19 258 aa8.81□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 CDRT15Q96T59 188 aa8.81□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 TMEM109Q9BVC6 243 aa8.81□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 OR51I2Q9H344 312 aa8.81□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 FN3KQ9H479 309 aa8.81□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 KCNG2Q9UJ96 466 aa8.81□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 MPC1Q9Y5U8 109 aa8.81□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 ANXA2P2A6NMY6 339 aa8.8□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 SLC22A2O15244 555 aa8.8□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 TBX1O43435 398 aa8.8□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 CST4P01036 141 aa8.8□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 TK1P04183 234 aa8.8□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP8.8□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 SPNP16150 400 aa8.8□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 PRDX2P32119 198 aa8.8□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 INSL3P51460 131 aa8.8□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 CYBRD1Q53TN4 286 aa8.8□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa8.8□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 ASPHD1Q5U4P2 390 aa8.8□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 DCXRQ7Z4W1 244 aa8.8□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa8.8□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 CAPSLQ8WWF8 208 aa8.8□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 RNFT2Q96EX2 444 aa8.8□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 OR8B4Q96RC9 309 aa8.8□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 EBF4Q9BQW3 602 aa8.8□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 COPS4Q9BT78 406 aa8.8□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 FNDC11Q9BVV2 318 aa8.8□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 C1orf21Q9H246 121 aa8.8□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.8□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 LINC01548A6NM66 108 aa8.79□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 M0QZK8 103 aa8.79□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 MMP23AO75900 390 aa8.79□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 HLA-DQA2P01906 255 aa8.79□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 GP9P14770 177 aa8.79□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 HTR1DP28221 377 aa8.79□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 OMPP47874 163 aa8.79□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 RPS6KA3P51812 740 aa8.79□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 SLC7A2P52569 658 aa8.79□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 TIGD6Q17RP2 521 aa8.79□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa8.79□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 KCTD8Q6ZWB6 473 aa8.79□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 Q8N1Y9 231 aa8.79□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 MREGQ8N565 214 aa8.79□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 COMMD1Q8N668 190 aa8.79□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 OR4K13Q8NH42 304 aa8.79□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 AQP3Q92482 292 aa8.79□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 STMN2Q93045 179 aa8.79□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 SLAMF6Q96DU3 332 aa8.79□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 ZNF488Q96MN9 340 aa8.79□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 VPS13DQ5THJ4 4388 aa8.78□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 TVP23AA6NH52 213 aa8.78□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 A8MZ25 164 aa8.78□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 SLC1A7O00341 560 aa8.78□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 CCRL2O00421 344 aa8.78□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa8.78□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 BRS3P32247 399 aa8.78□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 CX3CR1P49238 355 aa8.78□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 IDH3AP50213 366 aa8.78□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 GPM6AP51674 278 aa8.78□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 SELENOWP63302 87 aa8.78□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 IL18R1Q13478 541 aa8.78□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 SNAPC1Q16533 368 aa8.78□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 FAM27D1Q5T7N8 215 aa8.78□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 KRT74Q7RTS7 529 aa8.78□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 SATL1Q86VE3 508 aa8.78□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 STPG2Q8N412 459 aa8.78□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 DRAM1Q8N682 238 aa8.78□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 RNF152Q8N8N0 203 aa8.78□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 TPD52L3Q96J77 140 aa8.78□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 NDEL1Q9GZM8 345 aa8.78□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 CENPMQ9NSP4 180 aa8.78□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 RASL12Q9NYN1 266 aa8.78□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 DPM3Q9P2X0 92 aa8.78□□□□□ -1
CS-208ENST00000547298 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-208ENST00000547298 FAM90A18PA6NE21 464 aa8.77□□□□□ -1.01
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