RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 FBLN5Q9UBX5 448 aa5.34□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 SCOCQ9UIL1 159 aa5.34□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 FAM96BQ9Y3D0 163 aa5.34□□□□□ -1.56
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HOXD8-202ENST00000429017 BHLHE40O14503 412 aa5.33□□□□□ -1.56
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HOXD8-202ENST00000429017 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP5.33□□□□□ -1.56
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HOXD8-202ENST00000429017 EGLN3Q9H6Z9 239 aa5.33□□□□□ -1.56
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HOXD8-202ENST00000429017 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa5.33□□□□□ -1.56
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HOXD8-202ENST00000429017 SLC16A9Q7RTY1 509 aa5.32□□□□□ -1.56
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HOXD8-202ENST00000429017 ZNF823P16415 610 aa5.31□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 KIR2DS4P43632 304 aa5.31□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 UBE2E1P51965 193 aa5.31□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 PGBD2Q6P3X8 592 aa5.31□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF788Q6ZQV5 615 aa5.31□□□□□ -1.56
HOXD8-202ENST00000429017 Q6ZTK2 550 aa5.31□□□□□ -1.56
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