RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411660.1

RPS3AP25-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 25, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP25, Length 793 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP25-201ENST00000411660 MAGEA3P43357 314 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 RFX3P48380 749 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 PRPS1P60891 318 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 C17orf67Q0P5P2 114 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 HERPUD1Q15011 391 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 TGFBIQ15582 683 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 PDK4Q16654 411 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 CCNJQ5T5M9 372 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 ZNF620Q6ZNG0 422 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 OLIG3Q7RTU3 272 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 NAT8LQ8N9F0 302 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 ZNF675Q8TD23 568 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 GPR119Q8TDV5 335 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 RAB8BQ92930 207 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 APH1AQ96BI3 265 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 CMTM7Q96FZ5 175 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 RHOXF2Q9BQY4 288 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 ROGDIQ9GZN7 287 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 PTGES2Q9H7Z7 377 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 MS4A12Q9NXJ0 267 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 TAS2R13Q9NYV9 303 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 RNF213Q63HN8 5207 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 MYCBP2O75592 4640 aa3□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 M0R233 179 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 UPK1AO00322 258 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 UPK3AO75631 287 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 LHBP01229 141 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 TPM2P07951 284 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 BCKDHAP12694 445 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 PAX6P26367 422 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 POU3F4P49335 361 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 RGS4P49798 205 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 RAP1GDS1P52306 607 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 FOXA1P55317 472 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 UBE2HP62256 183 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 H3F3AP84243 136 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 IRF8Q02556 426 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 PHYHD1Q5SRE7 291 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 MED27Q6P2C8 311 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 MOB1BQ7L9L4 216 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 MDP1Q86V88 176 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 SBSPONQ8IVN8 264 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 CNTN4Q8IWV2 1026 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 C1orf174Q8IYL3 243 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 CADM2Q8N3J6 435 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 C17orf78Q8N4C9 275 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 FBXO30Q8TB52 745 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 C17orf50Q8WW18 174 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 RAB39BQ96DA2 213 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 OR5B2Q96R09 309 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 EFCAB11Q9BUY7 163 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 OR11A1Q9GZK7 315 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 DCLRE1BQ9H816 532 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 CAB39LQ9H9S4 337 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 EDA2RQ9HAV5 297 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 B3GNT2Q9NY97 397 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 UBAP1Q9NZ09 502 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 BFARQ9NZS9 450 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 RNF11Q9Y3C5 154 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 A0A087WZY1 265 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 OR7A17O14581 309 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 KERAO60938 352 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 STK16O75716 305 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 ECDO95905 644 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 OPN1SWP03999 348 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 CRYBA1P05813 215 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 UROSP10746 265 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 ELK4P28324 431 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 MAGEA6P43360 314 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 UCP2P55851 309 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 BASP1P80723 227 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 TGM3Q08188 693 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 SCARB2Q14108 478 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 PDK3Q15120 406 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 ZMYND11Q15326 602 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 TMEM107Q6UX40 140 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 CASP12Q6UXS9 341 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 COMMD6Q7Z4G1 85 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 TEX29Q8N6K0 151 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 GPATCH11Q8N954 259 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS3AP25-201ENST00000411660 OR4F15Q8NGB8 312 aa2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms