Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
MAGEA3P43357 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
MAGEA3P43357 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
MAGEA3P43357 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
MAGEA3P43357 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
MAGEA3P43357 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
MAGEA3P43357 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
MAGEA3P43357 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
MAGEA3P43357 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
MAGEA3P43357 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
MAGEA3P43357 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
MAGEA3P43357 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
MAGEA3P43357 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
MAGEA3P43357 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
MAGEA3P43357 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
MAGEA3P43357 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
MAGEA3P43357 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
MAGEA3P43357 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
MAGEA3P43357 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
MAGEA3P43357 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
MAGEA3P43357 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
MAGEA3P43357 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
MAGEA3P43357 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
MAGEA3P43357 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
MAGEA3P43357 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
MAGEA3P43357 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
MAGEA3P43357 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
MAGEA3P43357 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
MAGEA3P43357 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MAGEA3P43357 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
MAGEA3P43357 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
MAGEA3P43357 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
MAGEA3P43357 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
MAGEA3P43357 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
MAGEA3P43357 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
MAGEA3P43357 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
MAGEA3P43357 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
MAGEA3P43357 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
MAGEA3P43357 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
MAGEA3P43357 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
MAGEA3P43357 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
MAGEA3P43357 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
MAGEA3P43357 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
MAGEA3P43357 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
MAGEA3P43357 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
MAGEA3P43357 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
MAGEA3P43357 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MAGEA3P43357 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
MAGEA3P43357 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
MAGEA3P43357 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MAGEA3P43357 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MAGEA3P43357 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MAGEA3P43357 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
MAGEA3P43357 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MAGEA3P43357 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MAGEA3P43357 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MAGEA3P43357 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MAGEA3P43357 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MAGEA3P43357 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MAGEA3P43357 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MAGEA3P43357 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MAGEA3P43357 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MAGEA3P43357 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MAGEA3P43357 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MAGEA3P43357 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MAGEA3P43357 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MAGEA3P43357 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MAGEA3P43357 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MAGEA3P43357 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MAGEA3P43357 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MAGEA3P43357 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MAGEA3P43357 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
MAGEA3P43357 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MAGEA3P43357 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MAGEA3P43357 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MAGEA3P43357 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MAGEA3P43357 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MAGEA3P43357 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MAGEA3P43357 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MAGEA3P43357 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
MAGEA3P43357 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MAGEA3P43357 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MAGEA3P43357 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MAGEA3P43357 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MAGEA3P43357 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MAGEA3P43357 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MAGEA3P43357 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
MAGEA3P43357 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MAGEA3P43357 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MAGEA3P43357 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MAGEA3P43357 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MAGEA3P43357 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MAGEA3P43357 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MAGEA3P43357 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MAGEA3P43357 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MAGEA3P43357 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MAGEA3P43357 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MAGEA3P43357 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MAGEA3P43357 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MAGEA3P43357 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 292 ms