RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312492.2

HOXC5-201, Transcript of homeobox C5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC5, Length 1,805 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5-201ENST00000312492 SMPD2O60906 423 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 CCNKO75909 580 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 AGFG2O95081 481 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 HTR3BO95264 441 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 IGKV3-15P01624 115 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 FCER2P06734 321 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 RCVRNP35243 200 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 GNG2P59768 71 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 STEAP1BQ6NZ63 245 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 GFRALQ6UXV0 394 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 OR8S1Q8NH09 359 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 OR56B4Q8NH76 319 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 SLX1AQ9BQ83 275 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 MGAQ8IWI9 3026 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 CD3DP04234 171 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 RAG2P55895 527 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 PDZK1IP1Q13113 114 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 ASCL4Q6XD76 172 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 PXT1Q8NFP0 134 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 AMDHD2Q9Y303 409 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 CEP295Q9C0D2 2601 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 GLI4P10075 376 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 TMEM50BP56557 158 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 PPP1CBP62140 327 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 CEACAM21Q3KPI0 293 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 LINC00303Q3SY05 128 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 PLAC9Q5JTB6 97 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 SPATA46Q5T0L3 261 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 BHLHE23Q8NDY6 225 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 IFT46Q9NQC8 304 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 TUBD1Q9UJT1 453 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 PQLC2LA1A4F0 135 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 OR5H1A6NKK0 313 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 MFNGO00587 321 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 IL32P24001 234 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 ARL6IP1Q15041 203 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 FBXW12Q6X9E4 464 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 DOLPP1Q86YN1 238 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 OR4D10Q8NGI6 311 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 Q96M66 194 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 IL36GQ9NZH8 169 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 CRIM1Q9NZV1 1036 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 MPC1Q9Y5U8 109 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 NDUFB6O95139 128 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 RAB3DO95716 219 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 OR2T2Q6IF00 324 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 RTN4RL2Q86UN3 420 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 ZNF611Q8N823 705 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 OR51F2Q8NH61 342 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 HPSE2Q8WWQ2 592 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 CCDC120Q96HB5 630 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 KCNK7Q9Y2U2 307 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 LAMA5O15230 3695 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 PEX14O75381 377 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 GABRR1P24046 479 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 UCP2P55851 309 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 ARFRP1Q13795 201 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 CALHM1Q8IU99 346 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 OR5A2Q8NGI9 324 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 OR1J1Q8NGS3 322 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 OR2J1Q9GZK6 312 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 OR10A4Q9H209 315 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 ASF1BQ9NVP2 202 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 ZNF221Q9UK13 617 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 A0A0A6YYJ9 748 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 C7orf66A4D0T2 115 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 SSX5O60225 188 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 IGKV1D-12P01611 117 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 CD74P04233 296 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 CECR9P0C854 216 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 OPRM1P35372 400 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC5-201ENST00000312492 ID4P47928 161 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.2 ms