RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519295.5

AP3B1-204, Transcript of adaptor related protein complex 3 subunit beta 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AP3B1, Length 3,986 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1-204ENST00000519295 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 MT-ND4LP03901 98 aa4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 OR8U9P0C7N5 309 aa4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 MAKP20794 623 aa4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 CHRNB4P30926 498 aa4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 CD70P32970 193 aa4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 CDH11P55287 796 aa4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 ZNF616Q08AN1 781 aa4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 ZNF260Q3ZCT1 412 aa4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 AHSA2Q719I0 299 aa4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 SMIM20Q8N5G0 67 aa4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 BEST4Q8NFU0 473 aa4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 OR4X1Q8NH49 305 aa4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 PIK3IP1Q96FE7 263 aa4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 SLC35A4Q96G79 324 aa4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
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AP3B1-204ENST00000519295 A0A087X0T9 212 aa4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 A0A1B0GU03 582 aa4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 CDC14CA4D256 554 aa4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 TSTD3H0UI37 97 aa4.55□□□□□ -1.68
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AP3B1-204ENST00000519295 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 RAB5AP20339 215 aa4.55□□□□□ -1.68
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AP3B1-204ENST00000519295 CKS1BP61024 79 aa4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
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AP3B1-204ENST00000519295 TFDP3Q5H9I0 405 aa4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 TPRG1LQ5T0D9 272 aa4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 FAM45BPQ6NSW5 357 aa4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 ZNF529Q6P280 563 aa4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 Q8N402 240 aa4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 FBXO25Q8TCJ0 367 aa4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 SLC35E1Q96K37 410 aa4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 ZNF670Q9BS34 389 aa4.55□□□□□ -1.68
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AP3B1-204ENST00000519295 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
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AP3B1-204ENST00000519295 RAB38P57729 211 aa4.55□□□□□ -1.68
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AP3B1-204ENST00000519295 RD3Q7Z3Z2 195 aa4.55□□□□□ -1.68
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AP3B1-204ENST00000519295 SPICQ8N5J4 248 aa4.55□□□□□ -1.68
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AP3B1-204ENST00000519295 F6UZH7 168 aa4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 LY6LH3BQJ8 138 aa4.55□□□□□ -1.68
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AP3B1-204ENST00000519295 BDKRB1P46663 353 aa4.55□□□□□ -1.68
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AP3B1-204ENST00000519295 RPS24P62847 133 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
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AP3B1-204ENST00000519295 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 FGFRL1Q8N441 504 aa4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 OR4E2Q8NGC2 313 aa4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 OR56A4Q8NGH8 313 aa4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 OR1N2Q8NGR9 330 aa4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 LGALS14Q8TCE9 139 aa4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 STMN2Q93045 179 aa4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 LHX4Q969G2 390 aa4.55□□□□□ -1.68
AP3B1-204ENST00000519295 CMBLQ96DG6 245 aa4.55□□□□□ -1.68
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