RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 STMN2Q93045 179 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 RTL8AQ9BWD3 113 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 WDR13Q9H1Z4 485 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 OR51I2Q9H344 312 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 MOB1AQ9H8S9 216 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 GPR173Q9NS66 373 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 GNG8Q9UK08 70 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 LRCH1Q9Y2L9 728 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 SRRM5B3KS81 715 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF732B4DXR9 585 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 J3QLI3 93 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 AKR7A2O43488 359 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 WBP4O75554 376 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 DBTP11182 482 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 ATP6V1B1P15313 513 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 GNB2P62879 340 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 PAX8Q06710 450 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 CEACAM21Q3KPI0 293 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 CDONQ4KMG0 1287 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 KCTD8Q6ZWB6 473 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 C1QL2Q7Z5L3 287 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 FTMTQ8N4E7 242 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 OR8B3Q8NGG8 313 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 OR8B2Q96RD0 313 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 SNTG1Q9NSN8 517 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 ENPP5Q9UJA9 477 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 DAPL1A0PJW8 107 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM210A6NLX4 147 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 ADAM20O43506 726 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 SYNGR1O43759 233 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 SELLP14151 372 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 GATA3P23771 443 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 CFHR2P36980 270 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 SNCBQ16143 134 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 ZBTB37Q5TC79 503 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF691Q5VV52 312 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 PLCXD3Q63HM9 321 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 DOK3Q7L591 496 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 THAP5Q7Z6K1 395 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 LHFPL3Q86UP9 236 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 PHC2Q8IXK0 858 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 OR5T2Q8NGG2 359 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 OR52I1Q8NGK6 324 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 OR2G2Q8NGZ5 317 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 CNIH3Q8TBE1 160 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 RAB40AQ8WXH6 277 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 C22orf15Q8WYQ4 148 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 CCL13Q99616 98 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 FRRS1LQ9P0K9 344 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 CLN8Q9UBY8 286 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 OR5V1Q9UGF6 321 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 METRNQ9UJH8 293 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa8.91□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 E9PI62 339 aa8.91□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 J3QLW9 94 aa8.91□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 SYT7O43581 403 aa8.91□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 VENTXO95231 258 aa8.91□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 NRASP01111 189 aa8.91□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 IGHA1P01876 353 aa8.91□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa8.91□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF19P17023 458 aa8.91□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 EPHA1P21709 976 aa8.91□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 CPT2P23786 658 aa8.91□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 GNG3P63215 75 aa8.91□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 ACTC1P68032 377 aa8.91□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 ACTA1P68133 377 aa8.91□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 UBE2V2Q15819 145 aa8.91□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 CLVS2Q5SYC1 327 aa8.91□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 STUMQ69YW2 141 aa8.91□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 LAIR2Q6ISS4 152 aa8.91□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 NLRC3Q7RTR2 1065 aa8.91□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 BATF2Q8N1L9 274 aa8.91□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 ACBD7Q8N6N7 88 aa8.91□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 FAM216BQ8N7L0 139 aa8.91□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 OR5A2Q8NGI9 324 aa8.91□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 OR10Z1Q8NGY1 313 aa8.91□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 OR10AC1Q8NH08 325 aa8.91□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 AQP3Q92482 292 aa8.91□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 PELI1Q96FA3 418 aa8.91□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 C4orf36Q96KX1 117 aa8.91□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF488Q96MN9 340 aa8.91□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 RDH12Q96NR8 316 aa8.91□□□□□ -0.98
ATG4B-210ENST00000428861 TECTBQ96PL2 329 aa8.91□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 128.2 ms