RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318074.9

SYTL1-201, Transcript of synaptotagmin like 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYTL1, Length 1,900 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1-201ENST00000318074 CMAHPQ9Y471 501 aa16.55■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 RNF115Q9Y4L5 304 aa16.55■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 ATF1P18846 271 aa16.55■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 PRDX4Q13162 271 aa16.55■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 IDNKQ5T6J7 187 aa16.55■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 DDI2Q5TDH0 399 aa16.55■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 LINC00299Q6ZSB3 139 aa16.55■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 MOB3CQ70IA8 216 aa16.55■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 JAGN1Q8N5M9 183 aa16.55■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 UBASH3BQ8TF42 649 aa16.55■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 FAM222BQ8WU58 562 aa16.55■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 SPSB1Q96BD6 273 aa16.55■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 PIK3IP1Q96FE7 263 aa16.55■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa16.55■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 GFI1Q99684 422 aa16.55■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 GPR160Q9UJ42 338 aa16.55■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 SLC7A11Q9UPY5 501 aa16.55■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 IFITM5A6NNB3 132 aa16.54■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 LILRA1O75019 489 aa16.54■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 PLA2G2AP14555 144 aa16.54■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 KITLGP21583 273 aa16.54■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 PRKACBP22694 351 aa16.54■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 CA6P23280 308 aa16.54■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 ALKBH6Q3KRA9 238 aa16.54■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 ZNF404Q494X3 552 aa16.54■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 KRT74Q7RTS7 529 aa16.54■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa16.54■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa16.54■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 ZNF442Q9H7R0 627 aa16.54■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 RHBDL2Q9NX52 303 aa16.54■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 MPC1Q9Y5U8 109 aa16.54■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 HCFC1P51610 2035 aa16.54■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa16.53■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 A0A0G2JK05 382 aa16.53■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 DEFB108AA8MXU0 73 aa16.53■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 SHISA9B4DS77 424 aa16.53■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 J3QKU1 62 aa16.53■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 AIPO00170 330 aa16.53■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 ALDOBP05062 364 aa16.53■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 IGFBP2P18065 325 aa16.53■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP16.53■□□□□ 0.245e-10■■■■■ 29.8
SYTL1-201ENST00000318074 OR8G5Q8NG78 346 aa16.53■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 MCFD2Q8NI22 146 aa16.53■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 SYT3Q9BQG1 590 aa16.53■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 COL12A1Q99715 3063 aa16.53■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa16.53■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 SIAH2O43255 324 aa16.53■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 IGHV3-13P01766 116 aa16.53■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 MSMPQ1L6U9 139 aa16.53■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 CEACAM21Q3KPI0 293 aa16.53■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 TMEM255AQ5JRV8 349 aa16.53■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 C16orf87Q6PH81 154 aa16.53■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 LRP11Q86VZ4 500 aa16.53■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 SPACA5Q96QH8 159 aa16.53■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 TMEM100Q9NV29 134 aa16.53■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
SYTL1-201ENST00000318074 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
SYTL1-201ENST00000318074 MTCP1P56278 107 aa16.52■□□□□ 0.23
SYTL1-201ENST00000318074 KISS1Q15726 138 aa16.52■□□□□ 0.23
SYTL1-201ENST00000318074 HES5Q5TA89 166 aa16.52■□□□□ 0.23
SYTL1-201ENST00000318074 ZNF554Q86TJ5 538 aa16.52■□□□□ 0.23
SYTL1-201ENST00000318074 CDH26Q8IXH8 852 aa16.52■□□□□ 0.23
SYTL1-201ENST00000318074 BORCS8Q96FH0 119 aa16.52■□□□□ 0.23
SYTL1-201ENST00000318074 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
SYTL1-201ENST00000318074 COX4I2Q96KJ9 171 aa16.52■□□□□ 0.23
SYTL1-201ENST00000318074 SORCS2Q96PQ0 1159 aa16.52■□□□□ 0.23
SYTL1-201ENST00000318074 GPER1Q99527 375 aa16.52■□□□□ 0.23
SYTL1-201ENST00000318074 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
SYTL1-201ENST00000318074 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
SYTL1-201ENST00000318074 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
SYTL1-201ENST00000318074 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa16.52■□□□□ 0.23
SYTL1-201ENST00000318074 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa16.51■□□□□ 0.23
SYTL1-201ENST00000318074 PLSCR5A0PG75 271 aa16.51■□□□□ 0.23
SYTL1-201ENST00000318074 PRSS44E7EML9 344 aa16.51■□□□□ 0.23
SYTL1-201ENST00000318074 OR4A8P0C604 315 aa16.51■□□□□ 0.23
SYTL1-201ENST00000318074 PRF1P14222 555 aa16.51■□□□□ 0.23
SYTL1-201ENST00000318074 RBP2P50120 134 aa16.51■□□□□ 0.23
SYTL1-201ENST00000318074 FUT6P51993 359 aa16.51■□□□□ 0.23
SYTL1-201ENST00000318074 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
SYTL1-201ENST00000318074 DCDC5Q6ZRR9 648 aa16.51■□□□□ 0.23
SYTL1-201ENST00000318074 OR8S1Q8NH09 359 aa16.51■□□□□ 0.23
SYTL1-201ENST00000318074 CHPT1Q8WUD6 406 aa16.51■□□□□ 0.23
SYTL1-201ENST00000318074 HS3ST6Q96QI5 342 aa16.51■□□□□ 0.23
SYTL1-201ENST00000318074 UQCC2Q9BRT2 126 aa16.51■□□□□ 0.23
SYTL1-201ENST00000318074 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
SYTL1-201ENST00000318074 SLC22A4Q9H015 551 aa16.51■□□□□ 0.23
SYTL1-201ENST00000318074 MMP27Q9H306 513 aa16.51■□□□□ 0.23
SYTL1-201ENST00000318074 ABCB9Q9NP78 766 aa16.51■□□□□ 0.23
SYTL1-201ENST00000318074 J3QRK9 145 aa16.51■□□□□ 0.23
SYTL1-201ENST00000318074 TMEM127O75204 238 aa16.51■□□□□ 0.23
SYTL1-201ENST00000318074 ADIPOQQ15848 244 aa16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.4 ms