RNA–Protein interactions for RNA: YNL207W

RIO2, Essential serine kinase involved in the processing of 20S pre-rRNA, yeast

Gene RIO2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RIO2	YNL207W	SFP1	P32432	683 aa		3.65	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	YEL1	P34225	687 aa		3.65	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	TDP1	P38319	544 aa		3.65	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	YAP1802	P53309	568 aa		3.65	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	COG8	Q04632	607 aa		3.65	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	MLH3	Q12083	715 aa		3.65	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	TAF3	Q12297	353 aa		3.65	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	SFL1	P20134	766 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	PHO11	P35842	467 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	MNN4	P36044	1178 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	APT2	P36973	181 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	BRN1	P38170	754 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	PHO12	P38693	467 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	REV7	P38927	245 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	ALG12	P53730	551 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	DCS2	Q12123	353 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	KIN3	P22209	435 aa		3.63	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	SEC6	P32844	805 aa		3.63	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	YNL195C	P40168	261 aa		3.63	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	NDC80	P40460	691 aa		3.63	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	REC102	Q02721	264 aa		3.63	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	BNR1	P40450	1375 aa		3.63	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	PEX1	P24004	1043 aa		3.62	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	EMP70	P32802	667 aa		3.62	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	FLO10	P36170	1169 aa		3.62	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	YJL206C	P39529	758 aa		3.62	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	YJR039W	P47107	1121 aa		3.62	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	MET13	P53128	600 aa		3.62	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	TFB2	Q02939	513 aa		3.62	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	THI22	Q06490	572 aa		3.62	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	GIN4	Q12263	1142 aa		3.62	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		3.62	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	ECM3	Q99252	613 aa		3.62	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	YPT7	P32939	208 aa		3.61	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	SET3	P36124	751 aa		3.61	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	APN2	P38207	520 aa		3.61	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	MNN1	P39106	762 aa		3.61	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	CDC43	P18898	376 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	ADY2	P25613	283 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	BCS1	P32839	456 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	BDH2	P39713	417 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	MGS1	P40151	587 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	ATG4	P53867	494 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	YNL193W	P53870	558 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	DOS2	P54858	310 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	USV1	Q12132	391 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	ZRT2	Q12436	422 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	BIT2	P38346	545 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	BEM4	P39011	633 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	ARG2	P40360	574 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	COX18	P53239	316 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	VPS36	Q06696	566 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
RIO2	YNL207W	DMC1	P25453	334 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIO2	YNL207W	PPZ2	P33329	710 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIO2	YNL207W	GLG1	P36143	616 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIO2	YNL207W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RIO2	YNL207W	YHR202W	P38887	602 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIO2	YNL207W	YIL166C	P40445	542 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIO2	YNL207W	HLJ1	P48353	224 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIO2	YNL207W	ARO10	Q06408	635 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIO2	YNL207W	GUD1	Q07729	489 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIO2	YNL207W	AFT2	Q08957	416 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIO2	YNL207W	NDJ1	Q12366	352 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RIO2	YNL207W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RIO2	YNL207W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RIO2	YNL207W	PEX2	P32800	271 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RIO2	YNL207W	CTR1	P49573	406 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RIO2	YNL207W	YGL081W	P53156	320 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RIO2	YNL207W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RIO2	YNL207W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RIO2	YNL207W	PRP28	P23394	588 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIO2	YNL207W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RIO2	YNL207W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RIO2	YNL207W	FUB1	P25659	250 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIO2	YNL207W	YEL020C	P39994	560 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIO2	YNL207W	RFX1	P48743	811 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIO2	YNL207W	IMO32	P53219	342 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIO2	YNL207W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RIO2	YNL207W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RIO2	YNL207W	IME1	P21190	360 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIO2	YNL207W	YKU70	P32807	602 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIO2	YNL207W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RIO2	YNL207W	MIT1	P40002	666 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIO2	YNL207W	PIG2	P40187	538 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIO2	YNL207W	BIT61	P47041	543 aa		3.55	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 53 ms