RNA–Protein interactions for RNA: YNL109W

YNL109W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL109W, Length 546 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL109W	YNL109W	ATG4	P53867	494 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YNL109W	YNL109W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YNL109W	YNL109W	ATG33	Q06485	197 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YNL109W	YNL109W	NTG2	Q08214	380 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YNL109W	YNL109W	ZRT2	Q12436	422 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YNL109W	YNL109W	RPN13	O13563	156 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL109W	YNL109W	SFL1	P20134	766 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL109W	YNL109W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YNL109W	YNL109W	MIH1	P23748	554 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL109W	YNL109W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YNL109W	YNL109W	MAL31	P38156	614 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL109W	YNL109W	TDP1	P38319	544 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL109W	YNL109W	SFB3	P38810	929 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL109W	YNL109W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YNL109W	YNL109W	LYS9	P38999	446 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL109W	YNL109W	ATF1	P40353	525 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL109W	YNL109W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YNL109W	YNL109W	YJR008W	P47085	338 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL109W	YNL109W	RNH70	P53331	553 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL109W	YNL109W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YNL109W	YNL109W	TAF3	Q12297	353 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL109W	YNL109W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YNL109W	YNL109W	ABF1	P14164	731 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	SFP1	P32432	683 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	PPG1	P32838	368 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	SWE1	P32944	819 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	TAH11	P47112	604 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	BFA1	P47113	574 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	COX18	P53239	316 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	FHN1	P53279	174 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	YML122C	Q03207	126 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	PRP28	P23394	588 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	PHO11	P35842	467 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	PHO12	P38693	467 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	BDH2	P39713	417 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	PIG2	P40187	538 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	YNL193W	P53870	558 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	VPS72	Q03388	795 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	HMG1	P12683	1054 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	MNN4	P36044	1178 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	YKR075C	P36155	307 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	AIM14	P53109	570 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	TFB2	Q02939	513 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	GUD1	Q07729	489 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	SEC15	P22224	910 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	SPO11	P23179	398 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	PPZ2	P33329	710 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	ALG12	P53730	551 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	ARP4	P80428	489 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	TOM20	P35180	183 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	BIT2	P38346	545 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	GET2	P40056	285 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	YLR001C	Q07895	862 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	KCC4	P25389	1037 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	NTH1	P32356	751 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	PET127	P32606	800 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	BCS1	P32839	456 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	GMH1	P36125	273 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	YHR202W	P38887	602 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.03	□□□□□ -1.76	not detected
YNL109W	YNL109W	MGS1	P40151	587 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	MET13	P53128	600 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	THI22	Q06490	572 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	VHS3	Q08438	674 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	MLH3	Q12083	715 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	SUT2	Q12286	268 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	POM34	Q12445	299 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YNL109W	YNL109W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YNL109W	YNL109W	KIN82	P25341	720 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL109W	YNL109W	ADY2	P25613	283 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL109W	YNL109W	FUB1	P25659	250 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL109W	YNL109W	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YNL109W	YNL109W	YEL020C	P39994	560 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL109W	YNL109W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YNL109W	YNL109W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YNL109W	YNL109W	COQ11	Q05892	277 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL109W	YNL109W	ARO10	Q06408	635 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL109W	YNL109W	DCS2	Q12123	353 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL109W	YNL109W	USV1	Q12132	391 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL109W	YNL109W	TSR4	P25040	408 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL109W	YNL109W	SEC6	P32844	805 aa		4.01	□□□□□ -1.77

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.8 ms