RNA–Protein interactions for RNA: YJL114W

YJL114W, Transcript of Retrotransposon TYA Gag gene co-transcribed with TYB Pol, yeast

Gene YJL114W, Length 681 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL114W	YJL114W	MCD4	P36051	919 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YJL114W	YJL114W	GLG1	P36143	616 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YJL114W	YJL114W	YEN1	P40028	759 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YJL114W	YJL114W	ARG2	P40360	574 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YJL114W	YJL114W	PMT3	P47190	753 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YJL114W	YJL114W	THI7	Q05998	598 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YJL114W	YJL114W	THI73	Q07904	523 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YJL114W	YJL114W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YJL114W	YJL114W	SFL1	P20134	766 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YJL114W	YJL114W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YJL114W	YJL114W	ALY2	P47029	1046 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YJL114W	YJL114W	MET13	P53128	600 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YJL114W	YJL114W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YJL114W	YJL114W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YJL114W	YJL114W	SIR3	P06701	978 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YJL114W	YJL114W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YJL114W	YJL114W	APT2	P36973	181 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YJL114W	YJL114W	SFB3	P38810	929 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YJL114W	YJL114W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YJL114W	YJL114W	MGS1	P40151	587 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YJL114W	YJL114W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YJL114W	YJL114W	HXT16	P47185	567 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YJL114W	YJL114W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YJL114W	YJL114W	ORC4	P54791	529 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YJL114W	YJL114W	COG8	Q04632	607 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YJL114W	YJL114W	HOG1	P32485	435 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	BDH2	P39713	417 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	YEL020C	P39994	560 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	YGR237C	P50089	785 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	UME1	Q03010	460 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	GIN4	Q12263	1142 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.2	□□□□□ -1.74	not detected
YJL114W	YJL114W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	TOM20	P35180	183 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	NUP60	P39705	539 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	MTL1	P53214	551 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	ATG33	Q06485	197 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	YAP7	Q08182	245 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	ICT1	Q12385	394 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	EMP70	P32802	667 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	ORC2	P32833	620 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	YHR112C	P38716	378 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	FMO1	P38866	432 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	YFL052W	P43551	465 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	AIM14	P53109	570 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	GPG1	P53130	126 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	ATG4	P53867	494 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	NHX1	Q04121	633 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	GUD1	Q07729	489 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	NUP145	P49687	1317 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	PHO11	P35842	467 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	PHO12	P38693	467 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	HMG1	P12683	1054 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	MIH1	P23748	554 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	HSL7	P38274	827 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	CKB2	P38930	258 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	YJR096W	P47137	282 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	GLO1	P50107	326 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	SEC5	P89102	971 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	HFD1	Q04458	532 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	YDR338C	Q05497	695 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	MCM21	Q06675	368 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	LYS9	P38999	446 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	NPY1	P53164	384 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	FHN1	P53279	174 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	ZRT2	Q12436	422 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YJL114W	YJL114W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	MRC1	P25588	1096 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	UBS1	P38290	277 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	PAF1	P38351	445 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	PAC2	P39937	518 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	BNA2	P47125	453 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	FOL1	P53848	824 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	TMA17	Q12513	150 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	VPS34	P22543	875 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	TMT1	P32643	299 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.14	□□□□□ -1.75	not detected
YJL114W	YJL114W	REC102	Q02721	264 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	MLH3	Q12083	715 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	YLR149C	Q99296	730 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	EUG1	P32474	517 aa		4.13	□□□□□ -1.75

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