RNA–Protein interactions for RNA: YGR102C

GTF1, Transcript of Subunit of the trimeric GatFAB AmidoTransferase(AdT) complex, yeast

Gene GTF1, Length 552 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GTF1	YGR102C	SRP101	P32916	621 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	REC104	P33323	182 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	TFC4	P33339	1025 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	POA1	P38218	177 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	MET12	P46151	657 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	NIT2	P47016	307 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	SPC105	P53148	917 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	DAM1	P53267	343 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	SFB2	P53953	876 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	GUD1	Q07729	489 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	YLL058W	Q12198	575 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	SSM4	P40318	1319 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	GAL1	P04385	528 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	AEP2	P22136	580 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	PTP2	P29461	750 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	EMC3	P36039	253 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	GYP8	P43570	497 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	COG4	Q06096	861 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	NUP192	P47054	1683 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	HIS5	P07172	385 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	TRM2	P33753	639 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	MCD4	P36051	919 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	CHA4	P43634	648 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	YGR012W	P53206	393 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	SUN4	P53616	420 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	ATG33	Q06485	197 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	RSC3	Q06639	885 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	NTO1	Q12311	748 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GTF1	YGR102C	NPP1	P25353	742 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	FUN30	P31380	1131 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	HOG1	P32485	435 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	NIC96	P34077	839 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	PTH2	P34222	208 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	ERT1	P38140	529 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	RIM4	P38741	713 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	SLI1	P53304	468 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	MLC2	Q06580	163 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	PSR2	Q07949	397 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	MET7	Q08645	548 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	ENV7	Q12003	364 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	PUS9	Q12069	462 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	SPE1	P08432	466 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	DCG1	P32460	244 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	YKL133C	P36066	463 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	DID4	P36108	232 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	VID27	P40157	782 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	GYP7	P48365	746 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	YDR514C	Q04408	483 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	HMG1	P12683	1054 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	KCC4	P25389	1037 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	AIM14	P53109	570 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	GUP2	Q08929	609 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	PNS1	Q12412	539 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	KCS1	Q12494	1050 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	RMP1	Q12530	201 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	YRF1-2	P40105	1681 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	HSF1	P10961	833 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	RPN12	P32496	274 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	BIT2	P38346	545 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	MSE1	P48525	536 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	NIT3	P49954	291 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	YKE2	P52553	114 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	YDR338C	Q05497	695 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	REH1	Q06709	432 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	SPT7	P35177	1332 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	DAL3	P32459	195 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	YHL041W	P38730	149 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	EMP65	P40085	556 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	EXG2	P52911	562 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	KIN4	Q01919	800 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	ECM9	Q02202	377 aa		4.67	□□□□□ -1.66

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