RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 ADALQ6DHV7 355 aa11.53□□□□□ -0.56
HCG18-242ENST00000602319 Q6ZUG5 572 aa11.53□□□□□ -0.56
HCG18-242ENST00000602319 TCEANC2Q96MN5 208 aa11.53□□□□□ -0.56
HCG18-242ENST00000602319 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa11.52□□□□□ -0.56
HCG18-242ENST00000602319 SASH3O75995 380 aa11.52□□□□□ -0.56
HCG18-242ENST00000602319 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.56
HCG18-242ENST00000602319 TMEM139Q8IV31 216 aa11.52□□□□□ -0.56
HCG18-242ENST00000602319 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.56
HCG18-242ENST00000602319 KIAA1468Q9P260 1216 aa11.52□□□□□ -0.56
HCG18-242ENST00000602319 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.56
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HCG18-242ENST00000602319 TEX35Q5T0J7 233 aa11.52□□□□□ -0.57
HCG18-242ENST00000602319 TMCO3Q6UWJ1 677 aa11.52□□□□□ -0.57
HCG18-242ENST00000602319 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
HCG18-242ENST00000602319 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
HCG18-242ENST00000602319 TMEM94Q12767 1356 aa11.52□□□□□ -0.57
HCG18-242ENST00000602319 PALLDQ8WX93 1383 aa11.52□□□□□ -0.57
HCG18-242ENST00000602319 SH3TC1Q8TE82 1336 aa11.52□□□□□ -0.57
HCG18-242ENST00000602319 NLRP12P59046 1061 aa11.52□□□□□ -0.57
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HCG18-242ENST00000602319 H3BQV1 296 aa11.51□□□□□ -0.57
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HCG18-242ENST00000602319 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
HCG18-242ENST00000602319 IFFO2Q5TF58 517 aa11.51□□□□□ -0.57
HCG18-242ENST00000602319 FSIP1Q8NA03 581 aa11.51□□□□□ -0.57
HCG18-242ENST00000602319 DDX11Q96FC9 970 aa11.51□□□□□ -0.57
HCG18-242ENST00000602319 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP11.51□□□□□ -0.57
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HCG18-242ENST00000602319 STOX1Q6ZVD7 989 aa11.5□□□□□ -0.57
HCG18-242ENST00000602319 TMC6Q7Z403 805 aa11.5□□□□□ -0.57
HCG18-242ENST00000602319 SMARCE1Q969G3 411 aa11.5□□□□□ -0.57
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HCG18-242ENST00000602319 CARMIL3Q8ND23 1372 aa11.5□□□□□ -0.57
HCG18-242ENST00000602319 LAMB4A4D0S4 1761 aa11.5□□□□□ -0.57
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HCG18-242ENST00000602319 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa11.5□□□□□ -0.57
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HCG18-242ENST00000602319 UBXN4Q92575 508 aa11.49□□□□□ -0.57
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HCG18-242ENST00000602319 NEK11Q8NG66 645 aa11.48□□□□□ -0.57
HCG18-242ENST00000602319 PXDNQ92626 1479 aa11.48□□□□□ -0.57
HCG18-242ENST00000602319 GRM8O00222 908 aa11.48□□□□□ -0.57
HCG18-242ENST00000602319 NOP2P46087 812 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
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HCG18-242ENST00000602319 LINS1Q8NG48 757 aa11.48□□□□□ -0.57
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HCG18-242ENST00000602319 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
HCG18-242ENST00000602319 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
HCG18-242ENST00000602319 RABGGTAQ92696 567 aa11.47□□□□□ -0.57
HCG18-242ENST00000602319 TNRQ92752 1358 aa11.47□□□□□ -0.57
HCG18-242ENST00000602319 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa11.47□□□□□ -0.57
HCG18-242ENST00000602319 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa11.47□□□□□ -0.57
HCG18-242ENST00000602319 NRDCO43847 1150 aa11.47□□□□□ -0.57
HCG18-242ENST00000602319 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
HCG18-242ENST00000602319 FDPSP14324 419 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
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