RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597777.1

FARP1-222, Transcript of FERM, ARH/RhoGEF and pleckstrin domain protein 1, human

Gene FARP1, Length 3,841 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FARP1-222	ENST00000597777	CTSW	P56202	376 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FARP1-222	ENST00000597777	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FARP1-222	ENST00000597777	STAP2	Q9UGK3	403 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FARP1-222	ENST00000597777	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	CPLX1	O14810	134 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	PDE4C	Q08493	712 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	USP25	Q9UHP3	1055 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	AKT1S1	Q96B36	256 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	PALD1	Q9ULE6	856 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	EP400	Q96L91	3159 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	BECN2	A8MW95	431 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	SETDB2	Q96T68	719 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	GPR108	Q9NPR9	543 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	SASH1	O94885	1247 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	EYA2	O00167	538 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	GOLIM4	O00461	696 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		11.6	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	PHF14	O94880	888 aa		11.6	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		11.6	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	CCDC125	Q86Z20	511 aa		11.6	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		11.6	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	SDF4	Q9BRK5	362 aa		11.6	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		11.6	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		11.6	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		11.6	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		11.6	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	TRIM5	Q9C035	493 aa		11.6	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	GYS1	P13807	737 aa		11.59	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	ITGA6	P23229	1130 aa		11.59	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	ZNF827	Q17R98	1081 aa		11.59	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	SYNE4	Q8N205	404 aa		11.59	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	JAG2	Q9Y219	1238 aa		11.59	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	TIMM10	P62072	90 aa		11.59	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		11.59	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		11.59	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	GREM2	Q9H772	168 aa		11.59	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		11.59	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		11.59	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	ZNF609	O15014	1411 aa		11.59	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		11.59	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	RXRA	P19793	462 aa		11.59	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		11.59	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	FAM227B	Q96M60	508 aa		11.59	□□□□□ -0.55
FARP1-222	ENST00000597777	BAG6	P46379	1132 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FARP1-222	ENST00000597777	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
FARP1-222	ENST00000597777	ERFE	Q4G0M1	354 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FARP1-222	ENST00000597777	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FARP1-222	ENST00000597777	BIN1	O00499	593 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FARP1-222	ENST00000597777	TM4SF1	P30408	202 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FARP1-222	ENST00000597777	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FARP1-222	ENST00000597777	USP26	Q9BXU7	913 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FARP1-222	ENST00000597777	ABCF2	Q9UG63	623 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FARP1-222	ENST00000597777		A0A1B0GUL6	1792 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FARP1-222	ENST00000597777	NFIX	Q14938	502 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FARP1-222	ENST00000597777	TNNI3K	Q59H18	835 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FARP1-222	ENST00000597777	RNF20	Q5VTR2	975 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FARP1-222	ENST00000597777	TSC1	Q92574	1164 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FARP1-222	ENST00000597777	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FARP1-222	ENST00000597777	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FARP1-222	ENST00000597777	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
FARP1-222	ENST00000597777	TFCP2	Q12800	502 aa		11.57	□□□□□ -0.56

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