RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, human

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRD4-208	ENST00000597315	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		33.7	■■■□□ 2.99
BRD4-208	ENST00000597315	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		33.7	■■■□□ 2.99
BRD4-208	ENST00000597315	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		33.7	■■■□□ 2.99
BRD4-208	ENST00000597315	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		33.7	■■■□□ 2.98
BRD4-208	ENST00000597315	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	33.69	■■■□□ 2.98
BRD4-208	ENST00000597315	KLRK1	P26718	216 aa		33.68	■■■□□ 2.98
BRD4-208	ENST00000597315	SCN9A	Q15858	1988 aa		33.67	■■■□□ 2.98
BRD4-208	ENST00000597315	SNAP23	O00161	211 aa		33.67	■■■□□ 2.98
BRD4-208	ENST00000597315	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	33.67	■■■□□ 2.98
BRD4-208	ENST00000597315	METTL24	Q5JXM2	366 aa		33.67	■■■□□ 2.98
BRD4-208	ENST00000597315	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	33.67	■■■□□ 2.98
BRD4-208	ENST00000597315	IFFO2	Q5TF58	517 aa		33.67	■■■□□ 2.98
BRD4-208	ENST00000597315	MEIS3	Q99687	375 aa		33.67	■■■□□ 2.98
BRD4-208	ENST00000597315	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	33.67	■■■□□ 2.98
BRD4-208	ENST00000597315	SHTN1	A0MZ66	631 aa		33.66	■■■□□ 2.98
BRD4-208	ENST00000597315	UBE4A	Q14139	1066 aa		33.66	■■■□□ 2.98
BRD4-208	ENST00000597315	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	33.66	■■■□□ 2.98
BRD4-208	ENST00000597315	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	33.66	■■■□□ 2.98
BRD4-208	ENST00000597315	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	33.66	■■■□□ 2.98
BRD4-208	ENST00000597315	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		33.66	■■■□□ 2.98
BRD4-208	ENST00000597315	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	33.66	■■■□□ 2.98
BRD4-208	ENST00000597315	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		33.66	■■■□□ 2.98
BRD4-208	ENST00000597315	PASK	Q96RG2	1323 aa		33.65	■■■□□ 2.98
BRD4-208	ENST00000597315	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		33.65	■■■□□ 2.98
BRD4-208	ENST00000597315	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		33.65	■■■□□ 2.98
BRD4-208	ENST00000597315	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		33.64	■■■□□ 2.98
BRD4-208	ENST00000597315	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		33.64	■■■□□ 2.98
BRD4-208	ENST00000597315	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		33.64	■■■□□ 2.98
BRD4-208	ENST00000597315	CD209	Q9NNX6	404 aa		33.64	■■■□□ 2.98
BRD4-208	ENST00000597315	CREBZF	Q9NS37	354 aa		33.64	■■■□□ 2.98
BRD4-208	ENST00000597315	USP17L8	P0C7I0	530 aa		33.63	■■■□□ 2.97
BRD4-208	ENST00000597315	LRRC24	Q50LG9	513 aa		33.63	■■■□□ 2.97
BRD4-208	ENST00000597315	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		33.62	■■■□□ 2.97
BRD4-208	ENST00000597315	OGFOD1	Q8N543	542 aa		33.62	■■■□□ 2.97
BRD4-208	ENST00000597315	TNN	Q9UQP3	1299 aa		33.62	■■■□□ 2.97
BRD4-208	ENST00000597315	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		33.61	■■■□□ 2.97
BRD4-208	ENST00000597315	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	33.61	■■■□□ 2.97
BRD4-208	ENST00000597315	GTF2I	P78347	998 aa		33.61	■■■□□ 2.97
BRD4-208	ENST00000597315		A0A1B0GUL6	1792 aa		33.61	■■■□□ 2.97
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF609	O15014	1411 aa		33.61	■■■□□ 2.97
BRD4-208	ENST00000597315	PSME4	Q14997	1843 aa		33.6	■■■□□ 2.97
BRD4-208	ENST00000597315	DACT2	Q5SW24	774 aa		33.6	■■■□□ 2.97
BRD4-208	ENST00000597315	EYA2	O00167	538 aa		33.59	■■■□□ 2.97
BRD4-208	ENST00000597315	VPS37D	Q86XT2	251 aa		33.59	■■■□□ 2.97
BRD4-208	ENST00000597315	KLRG1	Q96E93	195 aa		33.59	■■■□□ 2.97
BRD4-208	ENST00000597315	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		33.59	■■■□□ 2.97
BRD4-208	ENST00000597315	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	33.58	■■■□□ 2.97
BRD4-208	ENST00000597315	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		33.58	■■■□□ 2.97
BRD4-208	ENST00000597315	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		33.58	■■■□□ 2.97
BRD4-208	ENST00000597315	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	33.58	■■■□□ 2.97
BRD4-208	ENST00000597315	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		33.57	■■■□□ 2.97
BRD4-208	ENST00000597315	PDE8B	O95263	885 aa		33.57	■■■□□ 2.96
BRD4-208	ENST00000597315	GNAI2	P04899	355 aa		33.57	■■■□□ 2.96
BRD4-208	ENST00000597315	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	33.57	■■■□□ 2.96
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	33.57	■■■□□ 2.96
BRD4-208	ENST00000597315	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	33.57	■■■□□ 2.96
BRD4-208	ENST00000597315	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		33.57	■■■□□ 2.96
BRD4-208	ENST00000597315	GML	Q99445	158 aa		33.57	■■■□□ 2.96
BRD4-208	ENST00000597315	IL1R1	P14778	569 aa		33.56	■■■□□ 2.96
BRD4-208	ENST00000597315	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	33.56	■■■□□ 2.96
BRD4-208	ENST00000597315	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		33.56	■■■□□ 2.96
BRD4-208	ENST00000597315	MXD3	Q9BW11	206 aa		33.56	■■■□□ 2.96
BRD4-208	ENST00000597315	SIL1	Q9H173	461 aa		33.56	■■■□□ 2.96
BRD4-208	ENST00000597315	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		33.56	■■■□□ 2.96
BRD4-208	ENST00000597315	FBXO3	Q9UK99	471 aa		33.56	■■■□□ 2.96
BRD4-208	ENST00000597315	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		33.56	■■■□□ 2.96
BRD4-208	ENST00000597315	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	33.55	■■■□□ 2.96
BRD4-208	ENST00000597315	EGFR	P00533	1210 aa		33.54	■■■□□ 2.96
BRD4-208	ENST00000597315	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	33.54	■■■□□ 2.96
BRD4-208	ENST00000597315	GYG1	P46976	350 aa		33.54	■■■□□ 2.96
BRD4-208	ENST00000597315	MMP14	P50281	582 aa		33.54	■■■□□ 2.96
BRD4-208	ENST00000597315	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		33.54	■■■□□ 2.96
BRD4-208	ENST00000597315	TRAF5	O00463	557 aa		33.53	■■■□□ 2.96
BRD4-208	ENST00000597315	SRGAP3	O43295	1099 aa		33.53	■■■□□ 2.96
BRD4-208	ENST00000597315	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	33.53	■■■□□ 2.96
BRD4-208	ENST00000597315	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	33.52	■■■□□ 2.96
BRD4-208	ENST00000597315	CIAO1	O76071	339 aa		33.52	■■■□□ 2.96
BRD4-208	ENST00000597315	MS4A1	P11836	297 aa		33.52	■■■□□ 2.96
BRD4-208	ENST00000597315	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		33.52	■■■□□ 2.96
BRD4-208	ENST00000597315	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		33.52	■■■□□ 2.96
BRD4-208	ENST00000597315	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	33.52	■■■□□ 2.96
BRD4-208	ENST00000597315	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		33.51	■■■□□ 2.95
BRD4-208	ENST00000597315	USP48	Q86UV5	1035 aa		33.51	■■■□□ 2.95
BRD4-208	ENST00000597315	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		33.51	■■■□□ 2.95
BRD4-208	ENST00000597315	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	33.51	■■■□□ 2.95
BRD4-208	ENST00000597315	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	33.51	■■■□□ 2.95
BRD4-208	ENST00000597315	SASH1	O94885	1247 aa		33.5	■■■□□ 2.95
BRD4-208	ENST00000597315	SLC5A1	P13866	664 aa		33.5	■■■□□ 2.95
BRD4-208	ENST00000597315	SCARF1	Q14162	830 aa		33.5	■■■□□ 2.95
BRD4-208	ENST00000597315	SULF1	Q8IWU6	871 aa		33.5	■■■□□ 2.95
BRD4-208	ENST00000597315	GGA3	Q9NZ52	723 aa		33.5	■■■□□ 2.95
BRD4-208	ENST00000597315	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	33.49	■■■□□ 2.95
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		33.49	■■■□□ 2.95
BRD4-208	ENST00000597315	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	33.48	■■■□□ 2.95	5e-12	■■■■□ 24.9
BRD4-208	ENST00000597315	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		33.48	■■■□□ 2.95
BRD4-208	ENST00000597315	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	33.48	■■■□□ 2.95
BRD4-208	ENST00000597315	COPRS	Q9NQ92	184 aa		33.48	■■■□□ 2.95
BRD4-208	ENST00000597315	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	33.48	■■■□□ 2.95
BRD4-208	ENST00000597315	JAG2	Q9Y219	1238 aa		33.48	■■■□□ 2.95
BRD4-208	ENST00000597315	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	33.47	■■■□□ 2.95

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