RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	COA1	Q9GZY4	146 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PPP4C-205	ENST00000563200	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	27.5	■■□□□ 1.99
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	27.5	■■□□□ 1.99
PPP4C-205	ENST00000563200	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PPP4C-205	ENST00000563200	VEGFB	P49765	207 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PPP4C-205	ENST00000563200	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PPP4C-205	ENST00000563200	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	27.49	■■□□□ 1.99
PPP4C-205	ENST00000563200	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	27.49	■■□□□ 1.99
PPP4C-205	ENST00000563200	SNAP23	O00161	211 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PPP4C-205	ENST00000563200	TAF5L	O75529	589 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PPP4C-205	ENST00000563200	DACT2	Q5SW24	774 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PPP4C-205	ENST00000563200	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	27.48	■■□□□ 1.99
PPP4C-205	ENST00000563200	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	27.48	■■□□□ 1.99
PPP4C-205	ENST00000563200	USP44	Q9H0E7	712 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PPP4C-205	ENST00000563200	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		27.47	■■□□□ 1.99
PPP4C-205	ENST00000563200	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		27.47	■■□□□ 1.99
PPP4C-205	ENST00000563200	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	27.47	■■□□□ 1.99
PPP4C-205	ENST00000563200	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		27.47	■■□□□ 1.99
PPP4C-205	ENST00000563200	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	27.47	■■□□□ 1.99
PPP4C-205	ENST00000563200	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	27.47	■■□□□ 1.99
PPP4C-205	ENST00000563200	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		27.46	■■□□□ 1.99
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		27.46	■■□□□ 1.99
PPP4C-205	ENST00000563200	USP17L8	P0C7I0	530 aa		27.45	■■□□□ 1.98
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNJ4	P48050	445 aa		27.45	■■□□□ 1.98
PPP4C-205	ENST00000563200	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	27.44	■■□□□ 1.98
PPP4C-205	ENST00000563200	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	27.44	■■□□□ 1.98
PPP4C-205	ENST00000563200	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	27.44	■■□□□ 1.98
PPP4C-205	ENST00000563200	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		27.44	■■□□□ 1.98
PPP4C-205	ENST00000563200	USP48	Q86UV5	1035 aa		27.44	■■□□□ 1.98
PPP4C-205	ENST00000563200	MXD3	Q9BW11	206 aa		27.44	■■□□□ 1.98
PPP4C-205	ENST00000563200	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		27.44	■■□□□ 1.98
PPP4C-205	ENST00000563200	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		27.43	■■□□□ 1.98
PPP4C-205	ENST00000563200	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	27.43	■■□□□ 1.98
PPP4C-205	ENST00000563200	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	27.42	■■□□□ 1.98
PPP4C-205	ENST00000563200	DLK2	Q6UY11	383 aa		27.42	■■□□□ 1.98
PPP4C-205	ENST00000563200	CD209	Q9NNX6	404 aa		27.42	■■□□□ 1.98
PPP4C-205	ENST00000563200	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		27.42	■■□□□ 1.98
PPP4C-205	ENST00000563200	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	27.42	■■□□□ 1.98
PPP4C-205	ENST00000563200	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		27.41	■■□□□ 1.98
PPP4C-205	ENST00000563200	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		27.41	■■□□□ 1.98
PPP4C-205	ENST00000563200	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		27.41	■■□□□ 1.98
PPP4C-205	ENST00000563200	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	27.41	■■□□□ 1.98
PPP4C-205	ENST00000563200	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		27.41	■■□□□ 1.98
PPP4C-205	ENST00000563200	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	27.41	■■□□□ 1.98
PPP4C-205	ENST00000563200	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		27.41	■■□□□ 1.98
PPP4C-205	ENST00000563200	SCARF1	Q14162	830 aa		27.4	■■□□□ 1.98
PPP4C-205	ENST00000563200	GGA3	Q9NZ52	723 aa		27.4	■■□□□ 1.98
PPP4C-205	ENST00000563200	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	27.4	■■□□□ 1.98
PPP4C-205	ENST00000563200	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		27.39	■■□□□ 1.98
PPP4C-205	ENST00000563200	ADM5	C9JUS6	153 aa		27.39	■■□□□ 1.97
PPP4C-205	ENST00000563200	IL1R1	P14778	569 aa		27.39	■■□□□ 1.97
PPP4C-205	ENST00000563200	PLIN1	O60240	522 aa		27.38	■■□□□ 1.97
PPP4C-205	ENST00000563200	GTF2I	P78347	998 aa		27.38	■■□□□ 1.97
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXW7	Q969H0	707 aa		27.38	■■□□□ 1.97
PPP4C-205	ENST00000563200	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		27.37	■■□□□ 1.97
PPP4C-205	ENST00000563200	CAPNS2	Q96L46	248 aa		27.37	■■□□□ 1.97
PPP4C-205	ENST00000563200	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	27.37	■■□□□ 1.97
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		27.37	■■□□□ 1.97
PPP4C-205	ENST00000563200	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		27.36	■■□□□ 1.97
PPP4C-205	ENST00000563200	MMP14	P50281	582 aa		27.36	■■□□□ 1.97
PPP4C-205	ENST00000563200	UBE4A	Q14139	1066 aa		27.36	■■□□□ 1.97
PPP4C-205	ENST00000563200	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	27.36	■■□□□ 1.97
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		27.36	■■□□□ 1.97
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		27.35	■■□□□ 1.97
PPP4C-205	ENST00000563200	SULF1	Q8IWU6	871 aa		27.35	■■□□□ 1.97
PPP4C-205	ENST00000563200	OGFOD1	Q8N543	542 aa		27.35	■■□□□ 1.97
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		27.35	■■□□□ 1.97
PPP4C-205	ENST00000563200	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		27.34	■■□□□ 1.97
PPP4C-205	ENST00000563200	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		27.34	■■□□□ 1.97
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC24	Q50LG9	513 aa		27.34	■■□□□ 1.97
PPP4C-205	ENST00000563200	WBP1L	Q9NX94	342 aa		27.34	■■□□□ 1.97
PPP4C-205	ENST00000563200	KIF16B	Q96L93	1317 aa		27.34	■■□□□ 1.97
PPP4C-205	ENST00000563200	ECE1	P42892	770 aa		27.33	■■□□□ 1.97
PPP4C-205	ENST00000563200	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	27.33	■■□□□ 1.97
PPP4C-205	ENST00000563200	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		27.33	■■□□□ 1.97
PPP4C-205	ENST00000563200	CERS5	Q8N5B7	392 aa		27.33	■■□□□ 1.97
PPP4C-205	ENST00000563200	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		27.33	■■□□□ 1.97
PPP4C-205	ENST00000563200	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		27.33	■■□□□ 1.97
PPP4C-205	ENST00000563200	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	27.33	■■□□□ 1.96
PPP4C-205	ENST00000563200	WNT10B	O00744	389 aa		27.32	■■□□□ 1.96
PPP4C-205	ENST00000563200	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	27.32	■■□□□ 1.96
PPP4C-205	ENST00000563200	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	27.32	■■□□□ 1.96
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	27.32	■■□□□ 1.96
PPP4C-205	ENST00000563200	IFFO2	Q5TF58	517 aa		27.31	■■□□□ 1.96
PPP4C-205	ENST00000563200	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	27.31	■■□□□ 1.96
PPP4C-205	ENST00000563200	FOXN1	O15353	648 aa		27.3	■■□□□ 1.96
PPP4C-205	ENST00000563200	SASH1	O94885	1247 aa		27.3	■■□□□ 1.96
PPP4C-205	ENST00000563200	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	27.3	■■□□□ 1.96
PPP4C-205	ENST00000563200	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	27.3	■■□□□ 1.96
PPP4C-205	ENST00000563200	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	27.3	■■□□□ 1.96
PPP4C-205	ENST00000563200	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	27.3	■■□□□ 1.96
PPP4C-205	ENST00000563200	CDCA5	Q96FF9	252 aa		27.3	■■□□□ 1.96
PPP4C-205	ENST00000563200	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	27.3	■■□□□ 1.96
PPP4C-205	ENST00000563200	GYG1	P46976	350 aa		27.29	■■□□□ 1.96
PPP4C-205	ENST00000563200	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	27.29	■■□□□ 1.96
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		27.28	■■□□□ 1.96
PPP4C-205	ENST00000563200	PDE8B	O95263	885 aa		27.28	■■□□□ 1.96
PPP4C-205	ENST00000563200	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	27.28	■■□□□ 1.96
PPP4C-205	ENST00000563200	HUNK	P57058	714 aa		27.28	■■□□□ 1.96

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