RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP13.56□□□□□ -0.24
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USP3-AS1-204ENST00000559861 EPB42P16452 691 aa13.53□□□□□ -0.24
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USP3-AS1-204ENST00000559861 GRIN2CQ14957 1233 aa13.51□□□□□ -0.25
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USP3-AS1-204ENST00000559861 TET3O43151 1660 aa13.43□□□□□ -0.26
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USP3-AS1-204ENST00000559861 LMTK2Q8IWU2 1503 aa13.41□□□□□ -0.26
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USP3-AS1-204ENST00000559861 ARHGAP4P98171 946 aa13.41□□□□□ -0.26
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USP3-AS1-204ENST00000559861 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
USP3-AS1-204ENST00000559861 KLF15Q9UIH9 416 aa13.41□□□□□ -0.26
USP3-AS1-204ENST00000559861 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
USP3-AS1-204ENST00000559861 ERBINQ96RT1 1412 aa13.4□□□□□ -0.26
USP3-AS1-204ENST00000559861 ADGRB3O60242 1522 aa13.4□□□□□ -0.26
USP3-AS1-204ENST00000559861 EFCAB6Q5THR3 1501 aa13.4□□□□□ -0.26
USP3-AS1-204ENST00000559861 FZD6O60353 706 aa13.4□□□□□ -0.26
USP3-AS1-204ENST00000559861 XYLBO75191 536 aa13.4□□□□□ -0.26
USP3-AS1-204ENST00000559861 LORP23490 312 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
USP3-AS1-204ENST00000559861 ADH6P28332 368 aa13.4□□□□□ -0.26
USP3-AS1-204ENST00000559861 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
USP3-AS1-204ENST00000559861 SYT9Q86SS6 491 aa13.4□□□□□ -0.26
USP3-AS1-204ENST00000559861 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa13.4□□□□□ -0.26
USP3-AS1-204ENST00000559861 EDEM1Q92611 657 aa13.4□□□□□ -0.26
USP3-AS1-204ENST00000559861 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
USP3-AS1-204ENST00000559861 PDGFAP04085 211 aa13.39□□□□□ -0.27
USP3-AS1-204ENST00000559861 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
USP3-AS1-204ENST00000559861 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
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