RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554186.1

LINC00520-201, long intergenic non-protein coding RNA 520, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00520, Length 831 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00520-201ENST00000554186 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00520-201ENST00000554186 OR13H1Q8NG92 308 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00520-201ENST00000554186 RBSNQ9H1K0 784 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00520-201ENST00000554186 PRDM2Q13029 1718 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 DHX15O43143 795 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 ADAM11O75078 769 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 CD68P34810 354 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 NFIAQ12857 509 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 CEP135Q66GS9 1140 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 FAM200AQ8TCP9 573 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 UBASH3BQ8TF42 649 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 COL26A1Q96A83 441 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 RASSF4Q9H2L5 321 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 PRMT3O60678 531 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 EPHA1P21709 976 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 OCLNQ16625 522 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 UBAP1LF5GYI3 381 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 GSC2O15499 205 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 A6NJR5 290 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 FSCN2O14926 492 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 CDC27P30260 824 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 TXKP42681 527 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 MUC3BQ9H195 1237 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 ABCC8Q09428 1581 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 FAM69CQ0P6D2 419 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 HYAL2Q12891 473 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 RNF43Q68DV7 783 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 DTX1Q86Y01 620 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 DCAF11Q8TEB1 546 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 MYRFLQ96LU7 910 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 MKNK1Q9BUB5 465 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 CEP41Q9BYV8 373 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 ZBTB39O15060 712 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 DUOXA2Q1HG44 320 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 C16orf46Q6P387 395 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 KLHDC7BQ96G42 594 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 DBNDD2Q9BQY9 259 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 RNF114Q9Y508 228 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00520-201ENST00000554186 KIF4AO95239 1232 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 ACPPP15309 386 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 BRD2P25440 801 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 PREPP48147 710 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 UVSSAQ2YD98 709 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 FAM20CQ8IXL6 584 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 SHKBP1Q8TBC3 707 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 STK32AQ8WU08 396 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 CUX1P39880 1505 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 RFX1P22670 979 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 SCNN1AP37088 669 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 ZAP70P43403 619 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 GPR152Q8TDT2 470 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 PBX4Q9BYU1 374 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 SYNJ1O43426 1573 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 FANCD2Q9BXW9 1451 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 BMP3P12645 472 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 HGSNATQ68CP4 663 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 CEP120Q8N960 986 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 PIK3R5Q8WYR1 880 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 FAM83CQ9BQN1 747 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 TMEM63CQ9P1W3 806 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 ADGRE2Q9UHX3 823 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 TMEM132AQ24JP5 1023 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 BEND4Q6ZU67 534 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 KLHL23Q8NBE8 558 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 SPACA7Q96KW9 195 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 ZMYND15Q9H091 742 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 KANSL3Q9P2N6 904 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 GRIK1P39086 918 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 NLRP12P59046 1061 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 CLEC10AQ8IUN9 316 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 SHISA5Q8N114 240 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 HHIPQ96QV1 700 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 ADAM19Q9H013 955 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 KCNF1Q9H3M0 494 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 SEC31BQ9NQW1 1179 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 CNTN3Q9P232 1028 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00520-201ENST00000554186 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.4 ms