RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550078.2

ZBED6-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED6, Length 12,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6-202ENST00000550078 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 CLCA2Q9UQC9 943 aa5.96□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 MAP3K11Q16584 847 aa5.96□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 CCDC14Q49A88 953 aa5.96□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 NLRP13Q86W25 1043 aa5.96□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 WHAMMQ8TF30 809 aa5.96□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 PPP1R14AQ96A00 147 aa5.96□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 SAT1P21673 171 aa5.96□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 FAM182BQ5T319 152 aa5.96□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 ISM2Q6H9L7 571 aa5.96□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 FAM107BQ9H098 131 aa5.96□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 NAPBQ9H115 298 aa5.96□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 SLC24A3Q9HC58 644 aa5.96□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 FAM47DPA6NHR8 397 aa5.96□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 CCDC169A6NNP5 214 aa5.96□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 SPTLC1O15269 473 aa5.96□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 E7EVH7 732 aa5.96□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 ADCY1Q08828 1119 aa5.96□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 SPECC1Q5M775 1068 aa5.96□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 ECHDC1Q9NTX5 307 aa5.96□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 CABLES1Q8TDN4 633 aa5.95□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 AACSQ86V21 672 aa5.95□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 RAB23Q9ULC3 237 aa5.95□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 HGSO14964 777 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 CCDC40Q4G0X9 1142 aa5.95□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 SCYL2Q6P3W7 929 aa5.95□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 CASC4Q6P4E1 433 aa5.95□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa5.95□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 DMRT2Q9Y5R5 561 aa5.95□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 SPTA1P02549 2419 aa5.95□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 OCRLQ01968 901 aa5.95□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 IMPG2Q9BZV3 1241 aa5.95□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 NIM1KQ8IY84 436 aa5.95□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 H0YIN7 160 aa5.95□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 KIF4AO95239 1232 aa5.95□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 NCAPG2Q86XI2 1143 aa5.95□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa5.95□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 FAM184BQ9ULE4 1060 aa5.95□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 COG6Q9Y2V7 657 aa5.95□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 CD2APQ9Y5K6 639 aa5.95□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 BRD2P25440 801 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 NSMCE1Q8WV22 266 aa5.95□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 M0R2C6 588 aa5.95□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 KIAA0754O94854 1291 aa5.95□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 CETN1Q12798 172 aa5.95□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.463e-8■■■□□ 14.6
ZBED6-202ENST00000550078 MCM8Q9UJA3 840 aa5.95□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 PNMA2Q9UL42 364 aa5.95□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 ZBTB7AO95365 584 aa5.95□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 TMEM266Q2M3C6 531 aa5.95□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 CAPN10Q9HC96 672 aa5.95□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 MKL2Q9ULH7 1088 aa5.95□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 FAM13BQ9NYF5 915 aa5.94□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 EEPD1Q7L9B9 569 aa5.94□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 WDR66Q8TBY9 1149 aa5.94□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 GNPATO15228 680 aa5.94□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 RALGDSQ12967 914 aa5.94□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 BRD3Q15059 726 aa5.94□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 MYSM1Q5VVJ2 828 aa5.94□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 EXO5Q9H790 373 aa5.94□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 EVC2Q86UK5 1308 aa5.94□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 TFRCP02786 760 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 CASP2P42575 452 aa5.94□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 ANAPC4Q9UJX5 808 aa5.94□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 TBCAO75347 108 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 NSMFQ6X4W1 530 aa5.94□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 USP37Q86T82 979 aa5.94□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 MIPOL1Q8TD10 442 aa5.94□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 LONRF3Q496Y0 759 aa5.94□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 C9orf131Q5VYM1 1079 aa5.94□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 GDPD2Q9HCC8 539 aa5.94□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa5.94□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 CCDC172P0C7W6 258 aa5.94□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 NEK4P51957 841 aa5.94□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa5.94□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 APPL2Q8NEU8 664 aa5.94□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 PNMA5Q96PV4 448 aa5.94□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa5.94□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 HAND2P61296 217 aa5.94□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP5.94□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 GAS2L3Q86XJ1 694 aa5.94□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa5.94□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 CCP110O43303 1012 aa5.93□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
ZBED6-202ENST00000550078 PLIN2Q99541 437 aa5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms