RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 FKTNO75072 461 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 TCIRG1Q13488 830 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 CFHR5Q9BXR6 569 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 COG6Q9Y2V7 657 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 CACNA1FO60840 1977 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 MVPQ14764 893 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 PROSER3Q2NL68 480 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 MOB2Q70IA6 237 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 UBE2Q2LH0YL09 131 aa25.09■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 RLBP1P12271 317 aa25.09■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 TSPYL6Q8N831 410 aa25.09■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 AGBL3Q8NEM8 1001 aa25.09■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 TBC1D16Q8TBP0 767 aa25.09■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 NECTIN2Q92692 538 aa25.09■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF609O15014 1411 aa25.09■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 ANXA1P04083 346 aa25.08■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 TRIM27P14373 513 aa25.08■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 COPS6Q7L5N1 327 aa25.08■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 C8orf58Q8NAV2 365 aa25.08■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 SREBF2Q12772 1141 aa25.07■■□□□ 1.6
CTDSP2-204ENST00000548823 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CTDSP2-204ENST00000548823 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
CTDSP2-204ENST00000548823 G3V3G9 751 aa25.05■■□□□ 1.6
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CTDSP2-204ENST00000548823 DCAF8Q5TAQ9 597 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDSP2-204ENST00000548823 XAGE3Q8WTP9 111 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDSP2-204ENST00000548823 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDSP2-204ENST00000548823 POTEFA5A3E0 1075 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDSP2-204ENST00000548823 MYOZ2Q9NPC6 264 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDSP2-204ENST00000548823 TNNQ9UQP3 1299 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDSP2-204ENST00000548823 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDSP2-204ENST00000548823 PODXL2Q9NZ53 605 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDSP2-204ENST00000548823 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDSP2-204ENST00000548823 USP17L8P0C7I0 530 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDSP2-204ENST00000548823 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CTDSP2-204ENST00000548823 GMLQ99445 158 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDSP2-204ENST00000548823 PSME4Q14997 1843 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDSP2-204ENST00000548823 RPS8P62241 208 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CTDSP2-204ENST00000548823 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CTDSP2-204ENST00000548823 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CTDSP2-204ENST00000548823 COL4A1P02462 1669 aa25.01■■□□□ 1.6
CTDSP2-204ENST00000548823 ALDH1A1P00352 501 aa25.01■■□□□ 1.59
CTDSP2-204ENST00000548823 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa25.01■■□□□ 1.59
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM89AQ96GI7 184 aa25.01■■□□□ 1.59
CTDSP2-204ENST00000548823 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
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CTDSP2-204ENST00000548823 HTTP42858 3142 aa25.01■■□□□ 1.59
CTDSP2-204ENST00000548823 NF2P35240 595 aa25■■□□□ 1.59
CTDSP2-204ENST00000548823 TRIM17Q9Y577 477 aa25■■□□□ 1.59
CTDSP2-204ENST00000548823 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
CTDSP2-204ENST00000548823 UFL1O94874 794 aa24.99■■□□□ 1.59
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CTDSP2-204ENST00000548823 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
CTDSP2-204ENST00000548823 OTOP1Q7RTM1 612 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDSP2-204ENST00000548823 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDSP2-204ENST00000548823 GGA1Q9UJY5 639 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDSP2-204ENST00000548823 TMEM57Q8N5G2 664 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDSP2-204ENST00000548823 ISCA1Q9BUE6 129 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDSP2-204ENST00000548823 CENPFP49454 3210 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDSP2-204ENST00000548823 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
CTDSP2-204ENST00000548823 NBPF9Q3BBW0 867 aa24.95■■□□□ 1.59
CTDSP2-204ENST00000548823 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
CTDSP2-204ENST00000548823 USP17L3A6NCW0 530 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDSP2-204ENST00000548823 USP17L4A6NCW7 530 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDSP2-204ENST00000548823 INHBEP58166 350 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDSP2-204ENST00000548823 SPRYD7Q5W111 196 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDSP2-204ENST00000548823 USP17L1Q7RTZ2 530 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDSP2-204ENST00000548823 ARMC9Q7Z3E5 817 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDSP2-204ENST00000548823 PLBD2Q8NHP8 589 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDSP2-204ENST00000548823 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
CTDSP2-204ENST00000548823 PTPRCP08575 1304 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDSP2-204ENST00000548823 EN2P19622 333 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CTDSP2-204ENST00000548823 PODNQ7Z5L7 613 aa24.93■■□□□ 1.58
CTDSP2-204ENST00000548823 ITPRIPQ8IWB1 547 aa24.93■■□□□ 1.58
CTDSP2-204ENST00000548823 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CTDSP2-204ENST00000548823 ARMC5Q96C12 935 aa24.93■■□□□ 1.58
CTDSP2-204ENST00000548823 CHMP4AQ9BY43 222 aa24.93■■□□□ 1.58
CTDSP2-204ENST00000548823 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CTDSP2-204ENST00000548823 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa24.93■■□□□ 1.58
CTDSP2-204ENST00000548823 PTPN22Q9Y2R2 807 aa24.93■■□□□ 1.58
CTDSP2-204ENST00000548823 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa24.93■■□□□ 1.58
CTDSP2-204ENST00000548823 IGHDP01880 384 aa24.92■■□□□ 1.58
CTDSP2-204ENST00000548823 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
CTDSP2-204ENST00000548823 LDLRAD1Q5T700 205 aa24.92■■□□□ 1.58
CTDSP2-204ENST00000548823 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa24.92■■□□□ 1.58
CTDSP2-204ENST00000548823 IFNL1Q8IU54 200 aa24.92■■□□□ 1.58
CTDSP2-204ENST00000548823 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
CTDSP2-204ENST00000548823 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDSP2-204ENST00000548823 WNT10BO00744 389 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDSP2-204ENST00000548823 KRT24Q2M2I5 525 aa24.91■■□□□ 1.58
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