RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TARSP26639 723 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CRKP46108 304 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CYP4X1Q8N118 509 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RNF217Q8TC41 542 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SH3TC2Q8TF17 1288 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ANKRD24Q8TF21 1146 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TCF12Q99081 682 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RUBCNLQ9H714 662 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KANSL2Q9H9L4 492 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPC25Q9HBM1 224 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GPAMQ9HCL2 828 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PCDH12Q9NPG4 1184 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FANCLQ9NW38 375 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPT2Q9UMR5 302 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TLR3O15455 904 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MMP20O60882 483 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CDC45O75419 566 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ACPPP15309 386 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LMNB2Q03252 620 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SEZ6Q53EL9 994 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WDR44Q5JSH3 913 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C6orf118Q5T5N4 469 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SHDQ96IW2 340 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ST7Q9NRC1 585 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRPA1O75762 1119 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BMP2P12643 396 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SMPD1P17405 629 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TTBK2Q6IQ55 1244 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NCAPG2Q86XI2 1143 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR13H1Q8NG92 308 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HPS1Q92902 700 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DNAJC7Q99615 494 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OSMRQ99650 979 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CEP44Q9C0F1 390 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KCNH4Q9UQ05 1017 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ESYT3A0FGR9 886 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RARAP10276 462 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MCM4P33991 863 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCINQ13939 588 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GRIN2CQ14957 1233 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TNNI3KQ59H18 835 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FBXW10Q5XX13 1052 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM196AQ6ZSG2 479 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRP10Q7Z4F1 713 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCNJLQ8IV13 435 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLITRK4Q8IW52 837 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LILRB2Q8N423 598 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FBXO27Q8NI29 283 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 APPBP2Q92624 585 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C11orf16Q9NQ32 467 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 METTL12A8MUP2 240 aa6.91□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TNFRSF10AO00220 468 aa6.91□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ENC1O14682 589 aa6.91□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRIM37O94972 964 aa6.91□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GRIA4P48058 902 aa6.91□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EIF6P56537 245 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.91□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AGMOQ6ZNB7 445 aa6.91□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CDAN1Q8IWY9 1227 aa6.91□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PGBD3Q8N328 593 aa6.91□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FERD3LQ96RJ6 166 aa6.91□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.91□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CRISPLD1Q9H336 500 aa6.91□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa6.91□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PAGE1O75459 146 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 F13A1P00488 732 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LMNB1P20700 586 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DDR2Q16832 855 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HOMER1Q86YM7 354 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRPM4Q8TD43 1214 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CRBNQ96SW2 442 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GSX2Q9BZM3 304 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SEC31BQ9NQW1 1179 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DZANK1Q9NVP4 752 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ACTR10Q9NZ32 417 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZFATQ9P243 1243 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRKAB1Q9Y478 270 aa6.9□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms