RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 CPA1P15085 419 aa9.81□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 ADORA1P30542 326 aa9.81□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF827Q17R98 1081 aa9.81□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 TTC39AQ5SRH9 613 aa9.81□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 PDRG1Q9NUG6 133 aa9.81□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1B0GUL6 1792 aa9.81□□□□□ -0.84
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PDE4D-208ENST00000502484 BRD1O95696 1058 aa9.81□□□□□ -0.84
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PDE4D-208ENST00000502484 ATP2B3Q16720 1220 aa9.81□□□□□ -0.84
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PDE4D-208ENST00000502484 CNNM1Q9NRU3 951 aa9.81□□□□□ -0.84
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PDE4D-208ENST00000502484 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
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PDE4D-208ENST00000502484 RTL9Q8NET4 1388 aa9.8□□□□□ -0.84
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PDE4D-208ENST00000502484 PDE8BO95263 885 aa9.8□□□□□ -0.84
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PDE4D-208ENST00000502484 KRT32Q14532 448 aa9.8□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 DSCC1Q9BVC3 393 aa9.8□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP9.8□□□□□ -0.84
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PDE4D-208ENST00000502484 MROH5Q6ZUA9 1318 aa9.8□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 COL24A1Q17RW2 1714 aa9.79□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa9.79□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 SMIM5Q71RC9 77 aa9.79□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 TAF6LQ9Y6J9 622 aa9.79□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 RPS6KA4O75676 772 aa9.79□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 LARGE1O95461 756 aa9.79□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 RPS6KB1P23443 525 aa9.79□□□□□ -0.84
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PDE4D-208ENST00000502484 AMIGO3Q86WK7 504 aa9.78□□□□□ -0.84
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PDE4D-208ENST00000502484 FAM177BA6PVY3 158 aa9.78□□□□□ -0.84
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PDE4D-208ENST00000502484 ANKRD1Q15327 319 aa9.78□□□□□ -0.84
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PDE4D-208ENST00000502484 CCDC152Q4G0S7 254 aa9.78□□□□□ -0.84
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PDE4D-208ENST00000502484 C4AP0C0L4 1744 aa9.77□□□□□ -0.84
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PDE4D-208ENST00000502484 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 ME3Q16798 604 aa9.77□□□□□ -0.85
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PDE4D-208ENST00000502484 M0R2C6 588 aa9.76□□□□□ -0.85
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PDE4D-208ENST00000502484 ST3GAL1Q11201 340 aa9.76□□□□□ -0.85
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PDE4D-208ENST00000502484 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 PI16Q6UXB8 463 aa9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
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PDE4D-208ENST00000502484 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-208ENST00000502484 SMC3Q9UQE7 1217 aa9.76□□□□□ -0.85
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