RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 NFIXQ14938 502 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 STYK1Q6J9G0 422 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 CHADLQ6NUI6 762 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 KLHL23Q8NBE8 558 aa5.46□□□□□ -1.54
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RABGGTB-213ENST00000496055 PXDNLA1KZ92 1463 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 C5P01031 1676 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 DYNC1I1O14576 645 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 CAND2O75155 1236 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 IL13P35225 146 aa5.46□□□□□ -1.54
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RABGGTB-213ENST00000496055 RMI1Q9H9A7 625 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 SUN2Q9UH99 717 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 LY75O60449 1722 aa5.45□□□□□ -1.54
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RABGGTB-213ENST00000496055 GUCY2CP25092 1073 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 CTR9Q6PD62 1173 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM212AQ96EL1 285 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 KDRP35968 1356 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 ERBB4Q15303 1308 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 OFD1O75665 1012 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 PARNO95453 639 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 NPR1P16066 1061 aa5.45□□□□□ -1.54
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RABGGTB-213ENST00000496055 ECE1P42892 770 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 E2F5Q15329 346 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 ICE2Q659A1 982 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 C16orf87Q6PH81 154 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 SUPT20HQ8NEM7 779 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 PPP4R2Q9NY27 417 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 GABBR1Q9UBS5 961 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 CFAP69A5D8W1 941 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 H0YHG0 523 aa5.45□□□□□ -1.54
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RABGGTB-213ENST00000496055 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
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RABGGTB-213ENST00000496055 IFT88Q13099 833 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF790Q6PG37 636 aa5.44□□□□□ -1.54
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RABGGTB-213ENST00000496055 C11orf96Q7Z7L8 435 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 GPATCH3Q96I76 525 aa5.44□□□□□ -1.54
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RABGGTB-213ENST00000496055 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP5.43□□□□□ -1.544e-43■■■■■ 44.1
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RABGGTB-213ENST00000496055 MS4A1P11836 297 aa5.43□□□□□ -1.54
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RABGGTB-213ENST00000496055 ZSCAN26Q16670 478 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 NIM1KQ8IY84 436 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-213ENST00000496055 CLUAP1Q96AJ1 413 aa5.43□□□□□ -1.54
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