RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478095.1

HDAC6-222, Transcript of histone deacetylase 6, human

TSL 4

Gene HDAC6, Length 620 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC6-222	ENST00000478095	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		12.82	□□□□□ -0.36
HDAC6-222	ENST00000478095	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
HDAC6-222	ENST00000478095	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		12.82	□□□□□ -0.36
HDAC6-222	ENST00000478095	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		12.82	□□□□□ -0.36
HDAC6-222	ENST00000478095	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HDAC6-222	ENST00000478095	YDJC	A8MPS7	323 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HDAC6-222	ENST00000478095	ECE2	O60344	883 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HDAC6-222	ENST00000478095	RAD17	O75943	681 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HDAC6-222	ENST00000478095	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
HDAC6-222	ENST00000478095	METTL24	Q5JXM2	366 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HDAC6-222	ENST00000478095	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HDAC6-222	ENST00000478095	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
HDAC6-222	ENST00000478095	RRAGC	Q9HB90	399 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HDAC6-222	ENST00000478095	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
HDAC6-222	ENST00000478095	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HDAC6-222	ENST00000478095	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HDAC6-222	ENST00000478095	MYH3	P11055	1940 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HDAC6-222	ENST00000478095	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HDAC6-222	ENST00000478095	LTBP1	Q14766	1721 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDAC6-222	ENST00000478095		G3V3G9	751 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDAC6-222	ENST00000478095	EYA2	O00167	538 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDAC6-222	ENST00000478095	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
HDAC6-222	ENST00000478095	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDAC6-222	ENST00000478095	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDAC6-222	ENST00000478095	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDAC6-222	ENST00000478095	SBF1	O95248	1867 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDAC6-222	ENST00000478095	MED23	Q9ULK4	1368 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDAC6-222	ENST00000478095	KIF3C	O14782	793 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDAC6-222	ENST00000478095	EVX2	Q03828	476 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDAC6-222	ENST00000478095	CXCL9	Q07325	125 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDAC6-222	ENST00000478095	MTX1	Q13505	466 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDAC6-222	ENST00000478095	PDE3A	Q14432	1141 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDAC6-222	ENST00000478095	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDAC6-222	ENST00000478095	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HDAC6-222	ENST00000478095	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HDAC6-222	ENST00000478095	GPC2	Q8N158	579 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HDAC6-222	ENST00000478095	SPEF2	Q9C093	1822 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HDAC6-222	ENST00000478095	POTEC	B2RU33	542 aa		12.77	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	PSMD14	O00487	310 aa		12.77	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	CEP85	Q6P2H3	762 aa		12.77	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		12.77	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	FBXW7	Q969H0	707 aa		12.77	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	COPRS	Q9NQ92	184 aa		12.77	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		12.77	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		12.77	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	CIAO1	O76071	339 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	PDE8B	O95263	885 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	SCNN1D	P51172	638 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	ATP8B2	P98198	1209 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	UBE4A	Q14139	1066 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	TNIP1	Q15025	636 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	COA1	Q9GZY4	146 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	GYG1	P46976	350 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	PODN	Q7Z5L7	613 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	SHTN1	A0MZ66	631 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	EPS15	P42566	896 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	TFCP2	Q12800	502 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	SSH3	Q8TE77	659 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	MXD3	Q9BW11	206 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	CD209	Q9NNX6	404 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	HACL1	Q9UJ83	578 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	JAG2	Q9Y219	1238 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	USP17L3	A6NCW0	530 aa		12.73	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	USP17L4	A6NCW7	530 aa		12.73	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	POTEI	P0CG38	1075 aa		12.73	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	POTEJ	P0CG39	1038 aa		12.73	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	FGFR2	P21802	821 aa		12.73	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	EPHX2	P34913	555 aa		12.73	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	12.73	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	ATP2B3	Q16720	1220 aa		12.73	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		12.73	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	CRBN	Q96SW2	442 aa		12.73	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	WDR90	Q96KV7	1748 aa		12.72	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	SLC5A1	P13866	664 aa		12.72	□□□□□ -0.37
HDAC6-222	ENST00000478095	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37

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