RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477334.1

RBM39-231, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-231	ENST00000477334	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	CHRD	Q9H2X0	955 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	CES1	P23141	567 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	PLAUR	Q03405	335 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	ADGRE1	Q14246	886 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	MBTPS1	Q14703	1052 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	GRIK5	Q16478	980 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	MSL1	Q68DK7	614 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	TTC9	Q92623	222 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	EREG	O14944	169 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	NEFL	P07196	543 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	ERCC3	P19447	782 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	7.42	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334		J3QW42	95 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	SOX18	P35713	384 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	CSRNP1	Q96S65	589 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	SIK1	P57059	783 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	HYAL2	Q12891	473 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	RGS22	Q8NE09	1264 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	PMEPA1	Q969W9	287 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	SETDB2	Q96T68	719 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RBM39-231	ENST00000477334	DYRK3	O43781	588 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	FBXO11	Q86XK2	927 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334		Q8N3U1	123 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	USP21	Q9UK80	565 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	PLD4	Q96BZ4	506 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	SPACA7	Q96KW9	195 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	NPHS2	Q9NP85	383 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	KIF4A	O95239	1232 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	GHRH	P01286	108 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	ACPP	P15309	386 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	TRPA1	O75762	1119 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	EDN3	P14138	238 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	ATP2B2	Q01814	1243 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	COL19A1	Q14993	1142 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	CEP120	Q8N960	986 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	RBSN	Q9H1K0	784 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	ATP11A	P98196	1134 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	PI16	Q6UXB8	463 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	GIPC2	Q8TF65	315 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	OSMR	Q99650	979 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334	RNF19A	Q9NV58	838 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM39-231	ENST00000477334		A0A1W2PP55	124 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	DLL1	O00548	723 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	7.33	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM39-231	ENST00000477334	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		7.33	□□□□□ -1.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms