RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440447.2

PTX4-202, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTX4, Length 1,117 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-202ENST00000440447 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.62■■□□□ 1.21
PTX4-202ENST00000440447 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
PTX4-202ENST00000440447 YDJCA8MPS7 323 aa22.61■■□□□ 1.21
PTX4-202ENST00000440447 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
PTX4-202ENST00000440447 CXCL9Q07325 125 aa22.61■■□□□ 1.21
PTX4-202ENST00000440447 TFCP2Q12800 502 aa22.61■■□□□ 1.21
PTX4-202ENST00000440447 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.61■■□□□ 1.21
PTX4-202ENST00000440447 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.61■■□□□ 1.21
PTX4-202ENST00000440447 PODNQ7Z5L7 613 aa22.61■■□□□ 1.21
PTX4-202ENST00000440447 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
PTX4-202ENST00000440447 LPIN2Q92539 896 aa22.61■■□□□ 1.21
PTX4-202ENST00000440447 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.61■■□□□ 1.21
PTX4-202ENST00000440447 IRS2Q9Y4H2 1338 aa22.6■■□□□ 1.21
PTX4-202ENST00000440447 RAD17O75943 681 aa22.6■■□□□ 1.21
PTX4-202ENST00000440447 SLC5A1P13866 664 aa22.6■■□□□ 1.21
PTX4-202ENST00000440447 FGFR2P21802 821 aa22.6■■□□□ 1.21
PTX4-202ENST00000440447 AAMPQ13685 434 aa22.6■■□□□ 1.21
PTX4-202ENST00000440447 TNIP1Q15025 636 aa22.6■■□□□ 1.21
PTX4-202ENST00000440447 ATP2B3Q16720 1220 aa22.6■■□□□ 1.21
PTX4-202ENST00000440447 GPC2Q8N158 579 aa22.6■■□□□ 1.21
PTX4-202ENST00000440447 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PTX4-202ENST00000440447 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.6■■□□□ 1.21
PTX4-202ENST00000440447 A0A1B0GUL6 1792 aa22.59■■□□□ 1.21
PTX4-202ENST00000440447 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.59■■□□□ 1.21
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PTX4-202ENST00000440447 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
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PTX4-202ENST00000440447 CD209Q9NNX6 404 aa22.58■■□□□ 1.21
PTX4-202ENST00000440447 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.58■■□□□ 1.21
PTX4-202ENST00000440447 GYG1P46976 350 aa22.57■■□□□ 1.2
PTX4-202ENST00000440447 VPS37DQ86XT2 251 aa22.57■■□□□ 1.2
PTX4-202ENST00000440447 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.57■■□□□ 1.2
PTX4-202ENST00000440447 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PTX4-202ENST00000440447 KCNQ5Q9NR82 932 aa22.57■■□□□ 1.2
PTX4-202ENST00000440447 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.57■■□□□ 1.2
PTX4-202ENST00000440447 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PTX4-202ENST00000440447 PSMD14O00487 310 aa22.55■■□□□ 1.2
PTX4-202ENST00000440447 IL1R1P14778 569 aa22.55■■□□□ 1.2
PTX4-202ENST00000440447 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.55■■□□□ 1.2
PTX4-202ENST00000440447 RRAGCQ9HB90 399 aa22.55■■□□□ 1.2
PTX4-202ENST00000440447 A0A1B0GUL7 405 aa22.54■■□□□ 1.2
PTX4-202ENST00000440447 USP17L3A6NCW0 530 aa22.54■■□□□ 1.2
PTX4-202ENST00000440447 USP17L4A6NCW7 530 aa22.54■■□□□ 1.2
PTX4-202ENST00000440447 TIMM10P62072 90 aa22.54■■□□□ 1.2
PTX4-202ENST00000440447 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.54■■□□□ 1.2
PTX4-202ENST00000440447 FBXW7Q969H0 707 aa22.54■■□□□ 1.2
PTX4-202ENST00000440447 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PTX4-202ENST00000440447 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.54■■□□□ 1.2
PTX4-202ENST00000440447 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.54■■□□□ 1.2
PTX4-202ENST00000440447 GPR108Q9NPR9 543 aa22.54■■□□□ 1.2
PTX4-202ENST00000440447 RAB11FIP3O75154 756 aa22.53■■□□□ 1.2
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PTX4-202ENST00000440447 BCAMP50895 628 aa22.53■■□□□ 1.2
PTX4-202ENST00000440447 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PTX4-202ENST00000440447 IQCA1LA6NCM1 817 aa22.52■■□□□ 1.2
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PTX4-202ENST00000440447 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.51■■□□□ 1.19
PTX4-202ENST00000440447 XAGE2Q96GT9 111 aa22.51■■□□□ 1.19
PTX4-202ENST00000440447 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
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PTX4-202ENST00000440447 ZNF609O15014 1411 aa22.49■■□□□ 1.19
PTX4-202ENST00000440447 WDR90Q96KV7 1748 aa22.49■■□□□ 1.19
PTX4-202ENST00000440447 POTECB2RU33 542 aa22.49■■□□□ 1.19
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PTX4-202ENST00000440447 DACT2Q5SW24 774 aa22.49■■□□□ 1.19
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PTX4-202ENST00000440447 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
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PTX4-202ENST00000440447 PHKA1P46020 1223 aa22.47■■□□□ 1.19
PTX4-202ENST00000440447 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PTX4-202ENST00000440447 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.47■■□□□ 1.19
PTX4-202ENST00000440447 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
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PTX4-202ENST00000440447 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.47■■□□□ 1.19
PTX4-202ENST00000440447 KIF3CO14782 793 aa22.46■■□□□ 1.19
PTX4-202ENST00000440447 EPS15P42566 896 aa22.46■■□□□ 1.19
PTX4-202ENST00000440447 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PTX4-202ENST00000440447 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PTX4-202ENST00000440447 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
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