RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436744.2

NICN1-204, Transcript of nicolin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NICN1, Length 1,271 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-204ENST00000436744 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.1■■□□□ 1.13
NICN1-204ENST00000436744 SASH1O94885 1247 aa22.1■■□□□ 1.13
NICN1-204ENST00000436744 FKBP1BP68106 108 aa22.1■■□□□ 1.13
NICN1-204ENST00000436744 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
NICN1-204ENST00000436744 DACT2Q5SW24 774 aa22.1■■□□□ 1.13
NICN1-204ENST00000436744 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.1■■□□□ 1.13
NICN1-204ENST00000436744 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.1■■□□□ 1.13
NICN1-204ENST00000436744 MED23Q9ULK4 1368 aa22.1■■□□□ 1.13
NICN1-204ENST00000436744 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.09■■□□□ 1.13
NICN1-204ENST00000436744 KLRK1P26718 216 aa22.09■■□□□ 1.13
NICN1-204ENST00000436744 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
NICN1-204ENST00000436744 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.09■■□□□ 1.13
NICN1-204ENST00000436744 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.09■■□□□ 1.13
NICN1-204ENST00000436744 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
NICN1-204ENST00000436744 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
NICN1-204ENST00000436744 MYH3P11055 1940 aa22.08■■□□□ 1.13
NICN1-204ENST00000436744 PRKG1Q13976 671 aa22.08■■□□□ 1.13
NICN1-204ENST00000436744 WNT10BO00744 389 aa22.07■■□□□ 1.12
NICN1-204ENST00000436744 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
NICN1-204ENST00000436744 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
NICN1-204ENST00000436744 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.07■■□□□ 1.12
NICN1-204ENST00000436744 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
NICN1-204ENST00000436744 FZD1Q9UP38 647 aa22.07■■□□□ 1.12
NICN1-204ENST00000436744 HTTP42858 3142 aa22.06■■□□□ 1.12
NICN1-204ENST00000436744 KSR2Q6VAB6 950 aa22.06■■□□□ 1.12
NICN1-204ENST00000436744 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
NICN1-204ENST00000436744 HDAC9Q9UKV0 1011 aa22.06■■□□□ 1.12
NICN1-204ENST00000436744 G2E3Q7L622 706 aa22.05■■□□□ 1.12
NICN1-204ENST00000436744 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
NICN1-204ENST00000436744 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.05■■□□□ 1.12
NICN1-204ENST00000436744 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
NICN1-204ENST00000436744 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.04■■□□□ 1.12
NICN1-204ENST00000436744 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
NICN1-204ENST00000436744 CENPFP49454 3210 aa22.03■■□□□ 1.12
NICN1-204ENST00000436744 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
NICN1-204ENST00000436744 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.03■■□□□ 1.12
NICN1-204ENST00000436744 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
NICN1-204ENST00000436744 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
NICN1-204ENST00000436744 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.03■■□□□ 1.12
NICN1-204ENST00000436744 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.03■■□□□ 1.12
NICN1-204ENST00000436744 OGFOD1Q8N543 542 aa22.03■■□□□ 1.12
NICN1-204ENST00000436744 COA1Q9GZY4 146 aa22.02■■□□□ 1.12
NICN1-204ENST00000436744 GPR25O00155 361 aa22.01■■□□□ 1.11
NICN1-204ENST00000436744 TM4SF4P48230 202 aa22.01■■□□□ 1.11
NICN1-204ENST00000436744 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.01■■□□□ 1.11
NICN1-204ENST00000436744 SNAP23O00161 211 aa22■■□□□ 1.11
NICN1-204ENST00000436744 NF2P35240 595 aa22■■□□□ 1.11
NICN1-204ENST00000436744 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
NICN1-204ENST00000436744 GTF2IP78347 998 aa22■■□□□ 1.11
NICN1-204ENST00000436744 NEXNQ0ZGT2 675 aa22■■□□□ 1.11
NICN1-204ENST00000436744 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22■■□□□ 1.11
NICN1-204ENST00000436744 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22■■□□□ 1.11
NICN1-204ENST00000436744 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22■■□□□ 1.11
NICN1-204ENST00000436744 H7C1W4 665 aa21.99■■□□□ 1.11
NICN1-204ENST00000436744 ITGA6P23229 1130 aa21.99■■□□□ 1.11
NICN1-204ENST00000436744 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
NICN1-204ENST00000436744 LEMD3Q9Y2U8 911 aa21.99■■□□□ 1.11
NICN1-204ENST00000436744 STK31Q9BXU1 1019 aa21.98■■□□□ 1.11
NICN1-204ENST00000436744 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
NICN1-204ENST00000436744 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
NICN1-204ENST00000436744 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
NICN1-204ENST00000436744 SREBF2Q12772 1141 aa21.96■■□□□ 1.11
NICN1-204ENST00000436744 SPRYD7Q5W111 196 aa21.96■■□□□ 1.11
NICN1-204ENST00000436744 ARMC9Q7Z3E5 817 aa21.96■■□□□ 1.11
NICN1-204ENST00000436744 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
NICN1-204ENST00000436744 CERS5Q8N5B7 392 aa21.96■■□□□ 1.11
NICN1-204ENST00000436744 SSC5DA1L4H1 1573 aa21.95■■□□□ 1.11
NICN1-204ENST00000436744 BRCA2P51587 3418 aa21.95■■□□□ 1.1
NICN1-204ENST00000436744 TAF5LO75529 589 aa21.95■■□□□ 1.1
NICN1-204ENST00000436744 SLC4A2P04920 1241 aa21.95■■□□□ 1.1
NICN1-204ENST00000436744 KCNJ4P48050 445 aa21.95■■□□□ 1.1
NICN1-204ENST00000436744 CASP7P55210 303 aa21.95■■□□□ 1.1
NICN1-204ENST00000436744 CHRNDQ07001 517 aa21.95■■□□□ 1.1
NICN1-204ENST00000436744 GCKRQ14397 625 aa21.95■■□□□ 1.1
NICN1-204ENST00000436744 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
NICN1-204ENST00000436744 LDLRAD1Q5T700 205 aa21.95■■□□□ 1.1
NICN1-204ENST00000436744 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
NICN1-204ENST00000436744 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.95■■□□□ 1.1
NICN1-204ENST00000436744 JAG2Q9Y219 1238 aa21.95■■□□□ 1.1
NICN1-204ENST00000436744 AOX1Q06278 1338 aa21.95■■□□□ 1.1
NICN1-204ENST00000436744 F8W031 263 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
NICN1-204ENST00000436744 FKTNO75072 461 aa21.94■■□□□ 1.1
NICN1-204ENST00000436744 CCDC184Q52MB2 194 aa21.94■■□□□ 1.1
NICN1-204ENST00000436744 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
NICN1-204ENST00000436744 CLMNQ96JQ2 1002 aa21.94■■□□□ 1.1
NICN1-204ENST00000436744 ANKRD2Q9GZV1 360 aa21.94■■□□□ 1.1
NICN1-204ENST00000436744 DEFB129Q9H1M3 183 aa21.94■■□□□ 1.1
NICN1-204ENST00000436744 CD209Q9NNX6 404 aa21.94■■□□□ 1.1
NICN1-204ENST00000436744 PLA2G12BQ9BX93 195 aa21.93■■□□□ 1.1
NICN1-204ENST00000436744 PCDH10Q9P2E7 1040 aa21.93■■□□□ 1.1
NICN1-204ENST00000436744 A0A1B0GUL6 1792 aa21.92■■□□□ 1.1
NICN1-204ENST00000436744 IRS2Q9Y4H2 1338 aa21.92■■□□□ 1.1
NICN1-204ENST00000436744 CLRN2A0PK11 232 aa21.92■■□□□ 1.1
NICN1-204ENST00000436744 FLIIQ13045 1269 aa21.92■■□□□ 1.1
NICN1-204ENST00000436744 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.92■■□□□ 1.1
NICN1-204ENST00000436744 CSF1RP07333 972 aa21.91■■□□□ 1.1
NICN1-204ENST00000436744 DLGAP5Q15398 846 aa21.91■■□□□ 1.1
NICN1-204ENST00000436744 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
NICN1-204ENST00000436744 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
NICN1-204ENST00000436744 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 117.9 ms