RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429299.2

LTB-210, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 897 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-210ENST00000429299 DACT2Q5SW24 774 aa25.06■■□□□ 1.6
LTB-210ENST00000429299 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
LTB-210ENST00000429299 MBIPQ9NS73 344 aa25.06■■□□□ 1.6
LTB-210ENST00000429299 MYO3BQ8WXR4 1341 aa25.06■■□□□ 1.6
LTB-210ENST00000429299 STRIP1Q5VSL9 837 aa25.05■■□□□ 1.6
LTB-210ENST00000429299 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.05■■□□□ 1.6
LTB-210ENST00000429299 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
LTB-210ENST00000429299 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
LTB-210ENST00000429299 MED23Q9ULK4 1368 aa25.05■■□□□ 1.6
LTB-210ENST00000429299 MINPP1Q9UNW1 487 aa25.04■■□□□ 1.6
LTB-210ENST00000429299 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
LTB-210ENST00000429299 ANP32CO43423 234 aa25.03■■□□□ 1.6
LTB-210ENST00000429299 ALDH1A1P00352 501 aa25.03■■□□□ 1.6
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LTB-210ENST00000429299 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
LTB-210ENST00000429299 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
LTB-210ENST00000429299 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
LTB-210ENST00000429299 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
LTB-210ENST00000429299 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
LTB-210ENST00000429299 ZNF853P0CG23 659 aa25.02■■□□□ 1.6
LTB-210ENST00000429299 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.02■■□□□ 1.6
LTB-210ENST00000429299 LDLRAD1Q5T700 205 aa25.02■■□□□ 1.6
LTB-210ENST00000429299 MXD3Q9BW11 206 aa25.02■■□□□ 1.6
LTB-210ENST00000429299 COA1Q9GZY4 146 aa25.02■■□□□ 1.6
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LTB-210ENST00000429299 INHBEP58166 350 aa25.01■■□□□ 1.59
LTB-210ENST00000429299 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
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LTB-210ENST00000429299 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa25.01■■□□□ 1.59
LTB-210ENST00000429299 CTSWP56202 376 aa25■■□□□ 1.59
LTB-210ENST00000429299 SPRYD7Q5W111 196 aa25■■□□□ 1.59
LTB-210ENST00000429299 TTLL11Q8NHH1 800 aa25■■□□□ 1.59
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LTB-210ENST00000429299 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.99■■□□□ 1.59
LTB-210ENST00000429299 TTLL5Q6EMB2 1281 aa24.98■■□□□ 1.59
LTB-210ENST00000429299 IFT57Q9NWB7 429 aa24.98■■□□□ 1.59
LTB-210ENST00000429299 LEMD3Q9Y2U8 911 aa24.98■■□□□ 1.59
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LTB-210ENST00000429299 SASH1O94885 1247 aa24.97■■□□□ 1.59
LTB-210ENST00000429299 PRKG1Q13976 671 aa24.97■■□□□ 1.59
LTB-210ENST00000429299 SLC10A4Q96EP9 437 aa24.97■■□□□ 1.59
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LTB-210ENST00000429299 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.96■■□□□ 1.59
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LTB-210ENST00000429299 TXNRD3Q86VQ6 643 aa24.95■■□□□ 1.58
LTB-210ENST00000429299 IFNL1Q8IU54 200 aa24.95■■□□□ 1.58
LTB-210ENST00000429299 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
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LTB-210ENST00000429299 OTOP1Q7RTM1 612 aa24.92■■□□□ 1.58
LTB-210ENST00000429299 CENPFP49454 3210 aa24.91■■□□□ 1.58
LTB-210ENST00000429299 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.91■■□□□ 1.58
LTB-210ENST00000429299 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
LTB-210ENST00000429299 GTF2IP78347 998 aa24.91■■□□□ 1.58
LTB-210ENST00000429299 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.91■■□□□ 1.58
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LTB-210ENST00000429299 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa24.9■■□□□ 1.58
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LTB-210ENST00000429299 ERO1AQ96HE7 468 aa24.89■■□□□ 1.58
LTB-210ENST00000429299 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
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LTB-210ENST00000429299 H7C1W4 665 aa24.88■■□□□ 1.57
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LTB-210ENST00000429299 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa24.88■■□□□ 1.57
LTB-210ENST00000429299 WNK4Q96J92 1243 aa24.88■■□□□ 1.57
LTB-210ENST00000429299 FZD1Q9UP38 647 aa24.88■■□□□ 1.57
LTB-210ENST00000429299 PTPN22Q9Y2R2 807 aa24.88■■□□□ 1.57
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LTB-210ENST00000429299 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.86■■□□□ 1.57
LTB-210ENST00000429299 APAF1O14727 1248 aa24.86■■□□□ 1.57
LTB-210ENST00000429299 KLRK1P26718 216 aa24.86■■□□□ 1.57
LTB-210ENST00000429299 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.86■■□□□ 1.57
LTB-210ENST00000429299 CLMNQ96JQ2 1002 aa24.86■■□□□ 1.57
LTB-210ENST00000429299 CD209Q9NNX6 404 aa24.86■■□□□ 1.57
LTB-210ENST00000429299 MYH3P11055 1940 aa24.86■■□□□ 1.57
LTB-210ENST00000429299 ITGA6P23229 1130 aa24.85■■□□□ 1.57
LTB-210ENST00000429299 KCNJ4P48050 445 aa24.85■■□□□ 1.57
LTB-210ENST00000429299 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
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