RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 HLA-CQ95604 372 aa8.85□□□□□ -0.99
HOXD8-202ENST00000429017 TIAM2Q8IVF5 1701 aa8.85□□□□□ -0.99
HOXD8-202ENST00000429017 HEG1Q9ULI3 1381 aa8.85□□□□□ -0.99
HOXD8-202ENST00000429017 A1BGP04217 495 aa8.84□□□□□ -0.99
HOXD8-202ENST00000429017 PLCB2Q00722 1185 aa8.84□□□□□ -0.99
HOXD8-202ENST00000429017 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF790Q6PG37 636 aa8.84□□□□□ -0.99
HOXD8-202ENST00000429017 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa8.84□□□□□ -0.99
HOXD8-202ENST00000429017 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
HOXD8-202ENST00000429017 H0YIN7 160 aa8.83□□□□□ -1
HOXD8-202ENST00000429017 PRR5LQ6MZQ0 368 aa8.83□□□□□ -1
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HOXD8-202ENST00000429017 GNAT3A8MTJ3 354 aa8.83□□□□□ -1
HOXD8-202ENST00000429017 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
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HOXD8-202ENST00000429017 CAMTA2O94983 1202 aa8.83□□□□□ -1
HOXD8-202ENST00000429017 STARD3NLO95772 234 aa8.83□□□□□ -1
HOXD8-202ENST00000429017 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
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HOXD8-202ENST00000429017 TTC5Q8N0Z6 440 aa8.83□□□□□ -1
HOXD8-202ENST00000429017 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa8.83□□□□□ -1
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HOXD8-202ENST00000429017 A0A087WZG4 1122 aa8.82□□□□□ -1
HOXD8-202ENST00000429017 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
HOXD8-202ENST00000429017 KDM4AO75164 1064 aa8.82□□□□□ -1
HOXD8-202ENST00000429017 VSIG8P0DPA2 414 aa8.82□□□□□ -1
HOXD8-202ENST00000429017 TEFQ10587 303 aa8.82□□□□□ -1
HOXD8-202ENST00000429017 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP8.82□□□□□ -1
HOXD8-202ENST00000429017 BRIP1Q9BX63 1249 aa8.82□□□□□ -1
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
HOXD8-202ENST00000429017 USP16Q9Y5T5 823 aa8.82□□□□□ -1
HOXD8-202ENST00000429017 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa8.82□□□□□ -1
HOXD8-202ENST00000429017 BCORQ6W2J9 1755 aa8.81□□□□□ -1
HOXD8-202ENST00000429017 SLX4Q8IY92 1834 aa8.81□□□□□ -1
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HOXD8-202ENST00000429017 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
HOXD8-202ENST00000429017 JUNDP17535 347 aa8.8□□□□□ -1
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HOXD8-202ENST00000429017 CACNA1SQ13698 1873 aa8.8□□□□□ -1
HOXD8-202ENST00000429017 SRGNP10124 158 aa8.8□□□□□ -1
HOXD8-202ENST00000429017 PDE6BP35913 854 aa8.8□□□□□ -1
HOXD8-202ENST00000429017 ERFEQ4G0M1 354 aa8.8□□□□□ -1
HOXD8-202ENST00000429017 ZFP42Q96MM3 310 aa8.8□□□□□ -1
HOXD8-202ENST00000429017 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
HOXD8-202ENST00000429017 LTBP3Q9NS15 1303 aa8.79□□□□□ -1
HOXD8-202ENST00000429017 BTBD11A6QL63 1104 aa8.79□□□□□ -1
HOXD8-202ENST00000429017 HOXA2O43364 376 aa8.79□□□□□ -1
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HOXD8-202ENST00000429017 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
HOXD8-202ENST00000429017 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
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HOXD8-202ENST00000429017 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa8.79□□□□□ -1
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HOXD8-202ENST00000429017 DCTN1Q14203 1278 aa8.78□□□□□ -1
HOXD8-202ENST00000429017 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
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HOXD8-202ENST00000429017 MCM10Q7L590 875 aa8.78□□□□□ -1
HOXD8-202ENST00000429017 NBPF15Q8N660 670 aa8.78□□□□□ -1
HOXD8-202ENST00000429017 CNKSR1Q969H4 720 aa8.77□□□□□ -1.01
HOXD8-202ENST00000429017 MASTLQ96GX5 879 aa8.77□□□□□ -1.01
HOXD8-202ENST00000429017 TAOK3Q9H2K8 898 aa8.77□□□□□ -1.01
HOXD8-202ENST00000429017 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
HOXD8-202ENST00000429017 ST5P78524 1137 aa8.76□□□□□ -1.01
HOXD8-202ENST00000429017 TNS4Q8IZW8 715 aa8.76□□□□□ -1.01
HOXD8-202ENST00000429017 EHBP1Q8NDI1 1231 aa8.76□□□□□ -1.01
HOXD8-202ENST00000429017 PCNTO95613 3336 aa8.76□□□□□ -1.01
HOXD8-202ENST00000429017 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
HOXD8-202ENST00000429017 PPP2R1AP30153 589 aa8.76□□□□□ -1.01
HOXD8-202ENST00000429017 SH3BP2P78314 561 aa8.76□□□□□ -1.01
HOXD8-202ENST00000429017 KCNMA1Q12791 1236 aa8.76□□□□□ -1.01
HOXD8-202ENST00000429017 HLFQ16534 295 aa8.76□□□□□ -1.01
HOXD8-202ENST00000429017 SMYD5Q6GMV2 418 aa8.76□□□□□ -1.01
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF541Q9H0D2 1346 aa8.75□□□□□ -1.01
HOXD8-202ENST00000429017 FAM177BA6PVY3 158 aa8.75□□□□□ -1.01
HOXD8-202ENST00000429017 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
HOXD8-202ENST00000429017 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP8.75□□□□□ -1.01
HOXD8-202ENST00000429017 GUCA2AQ02747 115 aa8.75□□□□□ -1.01
HOXD8-202ENST00000429017 CLEC4GQ6UXB4 293 aa8.75□□□□□ -1.01
HOXD8-202ENST00000429017 SLC51AQ86UW1 340 aa8.75□□□□□ -1.01
HOXD8-202ENST00000429017 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
HOXD8-202ENST00000429017 NUDT12Q9BQG2 462 aa8.75□□□□□ -1.01
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
HOXD8-202ENST00000429017 MIS18AQ9NYP9 233 aa8.75□□□□□ -1.01
HOXD8-202ENST00000429017 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
HOXD8-202ENST00000429017 SNED1Q8TER0 1413 aa8.75□□□□□ -1.01
HOXD8-202ENST00000429017 PASKQ96RG2 1323 aa8.74□□□□□ -1.01
HOXD8-202ENST00000429017 NPHP1O15259 732 aa8.74□□□□□ -1.01
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