RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424350.5

ANKRD54-206, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 597 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-206ENST00000424350 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa21.75■■□□□ 1.07
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ANKRD54-206ENST00000424350 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP21.74■■□□□ 1.07
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ANKRD54-206ENST00000424350 SLC10A4Q96EP9 437 aa21.74■■□□□ 1.07
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ANKRD54-206ENST00000424350 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
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ANKRD54-206ENST00000424350 MED23Q9ULK4 1368 aa21.7■■□□□ 1.06
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ANKRD54-206ENST00000424350 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.69■■□□□ 1.06
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ANKRD54-206ENST00000424350 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
ANKRD54-206ENST00000424350 ZNF333Q96JL9 665 aa21.68■■□□□ 1.06
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ANKRD54-206ENST00000424350 H0YGN5 161 aa21.67■■□□□ 1.06
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ANKRD54-206ENST00000424350 CAP1Q01518 475 aa21.67■■□□□ 1.06
ANKRD54-206ENST00000424350 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa21.67■■□□□ 1.06
ANKRD54-206ENST00000424350 OTUD5Q96G74 571 aa21.67■■□□□ 1.06
ANKRD54-206ENST00000424350 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
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ANKRD54-206ENST00000424350 DEFB129Q9H1M3 183 aa21.67■■□□□ 1.06
ANKRD54-206ENST00000424350 KIAA0825Q8IV33 1275 aa21.66■■□□□ 1.06
ANKRD54-206ENST00000424350 MYD88Q99836 296 aa21.66■■□□□ 1.06
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ANKRD54-206ENST00000424350 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
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ANKRD54-206ENST00000424350 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa21.6■■□□□ 1.05
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ANKRD54-206ENST00000424350 TTLL11Q8NHH1 800 aa21.58■■□□□ 1.05
ANKRD54-206ENST00000424350 GREM2Q9H772 168 aa21.58■■□□□ 1.05
ANKRD54-206ENST00000424350 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.58■■□□□ 1.05
ANKRD54-206ENST00000424350 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
ANKRD54-206ENST00000424350 KLRK1P26718 216 aa21.57■■□□□ 1.04
ANKRD54-206ENST00000424350 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa21.57■■□□□ 1.04
ANKRD54-206ENST00000424350 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
ANKRD54-206ENST00000424350 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa21.57■■□□□ 1.04
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ANKRD54-206ENST00000424350 MTMR14Q8NCE2 650 aa21.56■■□□□ 1.04
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