RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM63CQ9P1W3 806 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 STOML1Q9UBI4 398 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRK-202ENST00000368205 CARD10Q9BWT7 1032 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRK-202ENST00000368205 SEPT3Q9UH03 358 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRK-202ENST00000368205 SALL4Q9UJQ4 1053 aa8.52□□□□□ -1.05
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PTPRK-202ENST00000368205 ZNF438Q7Z4V0 828 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRK-202ENST00000368205 HELQQ8TDG4 1101 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRK-202ENST00000368205 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
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PTPRK-202ENST00000368205 H3BRJ5 948 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-202ENST00000368205 ADAM11O75078 769 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-202ENST00000368205 SSTR4P31391 388 aa8.5□□□□□ -1.05
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PTPRK-202ENST00000368205 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
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PTPRK-202ENST00000368205 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa8.48□□□□□ -1.05
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PTPRK-202ENST00000368205 SERPINA10Q9UK55 444 aa8.48□□□□□ -1.05
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PTPRK-202ENST00000368205 RNF43Q68DV7 783 aa8.47□□□□□ -1.05
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PTPRK-202ENST00000368205 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-202ENST00000368205 C1orf127Q8N9H9 656 aa8.47□□□□□ -1.05
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PTPRK-202ENST00000368205 EDEM1Q92611 657 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-202ENST00000368205 PMEPA1Q969W9 287 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-202ENST00000368205 C7orf69Q9H7B7 122 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-202ENST00000368205 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
PTPRK-202ENST00000368205 PDGFAP04085 211 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRK-202ENST00000368205 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
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PTPRK-202ENST00000368205 TRIM42Q8IWZ5 723 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRK-202ENST00000368205 DBNDD2Q9BQY9 259 aa8.46□□□□□ -1.06
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PTPRK-202ENST00000368205 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-202ENST00000368205 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-202ENST00000368205 CLEC10AQ8IUN9 316 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-202ENST00000368205 FAM20CQ8IXL6 584 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-202ENST00000368205 RNF208Q9H0X6 261 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-202ENST00000368205 CHRDQ9H2X0 955 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-202ENST00000368205 SOX13Q9UN79 622 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-202ENST00000368205 HMX2A2RU54 273 aa8.44□□□□□ -1.06
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PTPRK-202ENST00000368205 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRK-202ENST00000368205 FAM83CQ9BQN1 747 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRK-202ENST00000368205 HIF3AQ9Y2N7 669 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRK-202ENST00000368205 GRIK1P39086 918 aa8.43□□□□□ -1.06
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PTPRK-202ENST00000368205 PREPP48147 710 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRK-202ENST00000368205 LCE3BQ5TA77 95 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRK-202ENST00000368205 ALKBH2Q6NS38 261 aa8.43□□□□□ -1.06
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PTPRK-202ENST00000368205 PRR19A6NJB7 356 aa8.42□□□□□ -1.06
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PTPRK-202ENST00000368205 SPINK2P20155 84 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRK-202ENST00000368205 MPSTP25325 297 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRK-202ENST00000368205 C8orf34Q49A92 452 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRK-202ENST00000368205 TTC16Q8NEE8 873 aa8.42□□□□□ -1.06
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PTPRK-202ENST00000368205 A6NHS1 94 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRK-202ENST00000368205 BMP3P12645 472 aa8.41□□□□□ -1.06
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PTPRK-202ENST00000368205 ARL4DP49703 201 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRK-202ENST00000368205 NLRP12P59046 1061 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRK-202ENST00000368205 C19orf57Q0VDD7 668 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRK-202ENST00000368205 BEND4Q6ZU67 534 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRK-202ENST00000368205 NXPE3Q969Y0 559 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRK-202ENST00000368205 HHIPQ96QV1 700 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRK-202ENST00000368205 TRPA1O75762 1119 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRK-202ENST00000368205 SSFA2P28290 1259 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRK-202ENST00000368205 FDX2Q6P4F2 183 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRK-202ENST00000368205 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PTPRK-202ENST00000368205 BSNDQ8WZ55 320 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM88BA6NKF7 163 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRK-202ENST00000368205 IRAK1P51617 712 aa8.39□□□□□ -1.07
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