RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308271.13

USP48-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP48, Length 4,595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP48-201ENST00000308271 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.06■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa22.06■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 PBRM1Q86U86 1689 aa22.06■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 COPS6Q7L5N1 327 aa22.06■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 ZNF569Q5MCW4 686 aa22.06■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 GPATCH11Q8N954 259 aa22.06■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 NLRP5P59047 1200 aa22.06■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 TUBB2AQ13885 445 aa22.06■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.06■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 TUBB2BQ9BVA1 445 aa22.06■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 HSF2BPO75031 334 aa22.05■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 FAM227BQ96M60 508 aa22.05■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 HOXB7P09629 217 aa22.05■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 SSH3Q8TE77 659 aa22.05■■□□□ 1.12
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USP48-201ENST00000308271 TSG101Q99816 390 aa22.05■■□□□ 1.12
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USP48-201ENST00000308271 ARHGAP6O43182 974 aa22.05■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 AFMP43652 599 aa22.05■■□□□ 1.12
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USP48-201ENST00000308271 STAP2Q9UGK3 403 aa22.05■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 STARD3NLO95772 234 aa22.04■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa22.04■■□□□ 1.12
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USP48-201ENST00000308271 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.04■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 TTC6Q86TZ1 520 aa22.04■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa22.04■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 OPA1O60313 960 aa22.04■■□□□ 1.12
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USP48-201ENST00000308271 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 CHST3Q7LGC8 479 aa22.03■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.03■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.03■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.03■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.03■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.123e-6■■■□□ 17.5
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USP48-201ENST00000308271 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 PHACTR2O75167 634 aa22.02■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 RHOXF2BP0C7M4 288 aa22.02■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 UBA7P41226 1012 aa22.02■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 KRT83P78385 493 aa22.02■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 LRRC8AQ8IWT6 810 aa22.02■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 RHOXF2Q9BQY4 288 aa22.02■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.02■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 ATP10AO60312 1499 aa22.02■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 SLC5A1P13866 664 aa22.02■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.02■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.02■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 TRIM47Q96LD4 638 aa22.02■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 KRT86O43790 486 aa22.02■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 NLRP12P59046 1061 aa22.02■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 IFFO1Q0D2I5 559 aa22.02■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 AKR1B10O60218 316 aa22.02■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 WTAPQ15007 396 aa22.02■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 ANO1Q5XXA6 986 aa22.02■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 VPS36Q86VN1 386 aa22.02■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.02■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 KRT23Q9C075 422 aa22.02■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.02■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.01■■□□□ 1.11
USP48-201ENST00000308271 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.111e-8■■■□□ 17.7
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USP48-201ENST00000308271 RTN1Q16799 776 aa22.01■■□□□ 1.11
USP48-201ENST00000308271 MICALL1Q8N3F8 863 aa22.01■■□□□ 1.11
USP48-201ENST00000308271 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
USP48-201ENST00000308271 NR1I2O75469 434 aa22.01■■□□□ 1.11
USP48-201ENST00000308271 CHMP4BP1P59074 171 aa22.01■■□□□ 1.11
USP48-201ENST00000308271 AMPD3Q01432 767 aa22.01■■□□□ 1.11
USP48-201ENST00000308271 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
USP48-201ENST00000308271 DNA2P51530 1060 aa22■■□□□ 1.11
USP48-201ENST00000308271 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22■■□□□ 1.11
USP48-201ENST00000308271 TRIM75PA6NK02 468 aa22■■□□□ 1.11
USP48-201ENST00000308271 DTNBO60941 627 aa22■■□□□ 1.11
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USP48-201ENST00000308271 TFCP2Q12800 502 aa22■■□□□ 1.11
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USP48-201ENST00000308271 A0A1B0GUL7 405 aa21.99■■□□□ 1.11
USP48-201ENST00000308271 JAK2O60674 1132 aa21.99■■□□□ 1.11
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USP48-201ENST00000308271 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa21.99■■□□□ 1.11
USP48-201ENST00000308271 CCDC178Q5BJE1 867 aa21.99■■□□□ 1.11
USP48-201ENST00000308271 RAB34Q9BZG1 259 aa21.99■■□□□ 1.11
USP48-201ENST00000308271 USP44Q9H0E7 712 aa21.99■■□□□ 1.11
USP48-201ENST00000308271 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
USP48-201ENST00000308271 ATP7AQ04656 1500 aa21.99■■□□□ 1.11
USP48-201ENST00000308271 ZNF202O95125 648 aa21.99■■□□□ 1.11
USP48-201ENST00000308271 MAATS1Q7Z4T9 603 aa21.99■■□□□ 1.11
USP48-201ENST00000308271 STRN4Q9NRL3 753 aa21.99■■□□□ 1.11
USP48-201ENST00000308271 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.99■■□□□ 1.11
USP48-201ENST00000308271 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
USP48-201ENST00000308271 MYO1BO43795 1136 aa21.99■■□□□ 1.11
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