RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308271.13

USP48-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP48, Length 4,595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP48-201ENST00000308271 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
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USP48-201ENST00000308271 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.06■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa22.06■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 PBRM1Q86U86 1689 aa22.06■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 COPS6Q7L5N1 327 aa22.06■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
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USP48-201ENST00000308271 TUBB2BQ9BVA1 445 aa22.06■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 HSF2BPO75031 334 aa22.05■■□□□ 1.12
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USP48-201ENST00000308271 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.03■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.03■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.03■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.03■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.123e-6■■■□□ 17.5
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USP48-201ENST00000308271 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 PHACTR2O75167 634 aa22.02■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 RHOXF2BP0C7M4 288 aa22.02■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 UBA7P41226 1012 aa22.02■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 KRT83P78385 493 aa22.02■■□□□ 1.12
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USP48-201ENST00000308271 RHOXF2Q9BQY4 288 aa22.02■■□□□ 1.12
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USP48-201ENST00000308271 VPS36Q86VN1 386 aa22.02■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.02■■□□□ 1.12
USP48-201ENST00000308271 KRT23Q9C075 422 aa22.02■■□□□ 1.12
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USP48-201ENST00000308271 RTN1Q16799 776 aa22.01■■□□□ 1.11
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USP48-201ENST00000308271 CHMP4BP1P59074 171 aa22.01■■□□□ 1.11
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USP48-201ENST00000308271 TRIM75PA6NK02 468 aa22■■□□□ 1.11
USP48-201ENST00000308271 DTNBO60941 627 aa22■■□□□ 1.11
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USP48-201ENST00000308271 A0A1B0GUL7 405 aa21.99■■□□□ 1.11
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USP48-201ENST00000308271 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
USP48-201ENST00000308271 ATP7AQ04656 1500 aa21.99■■□□□ 1.11
USP48-201ENST00000308271 ZNF202O95125 648 aa21.99■■□□□ 1.11
USP48-201ENST00000308271 MAATS1Q7Z4T9 603 aa21.99■■□□□ 1.11
USP48-201ENST00000308271 STRN4Q9NRL3 753 aa21.99■■□□□ 1.11
USP48-201ENST00000308271 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.99■■□□□ 1.11
USP48-201ENST00000308271 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
USP48-201ENST00000308271 MYO1BO43795 1136 aa21.99■■□□□ 1.11
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