RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269143.7

AFG3L2-201, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AFG3L2, Length 3,247 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2-201ENST00000269143 ATG3Q9NT62 314 aa19.1■□□□□ 0.65
AFG3L2-201ENST00000269143 Q6ZUG5 572 aa19.1■□□□□ 0.65
AFG3L2-201ENST00000269143 PI4KAP2A4QPH2 592 aa19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2-201ENST00000269143 SART3Q15020 963 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2-201ENST00000269143 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2-201ENST00000269143 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2-201ENST00000269143 KCNB2Q92953 911 aa19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2-201ENST00000269143 EVI5LQ96CN4 794 aa19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2-201ENST00000269143 UBXN6Q9BZV1 441 aa19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2-201ENST00000269143 ACTN2P35609 894 aa19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2-201ENST00000269143 CCT2P78371 535 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2-201ENST00000269143 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2-201ENST00000269143 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2-201ENST00000269143 GPATCH3Q96I76 525 aa19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2-201ENST00000269143 WDR24Q96S15 920 aa19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2-201ENST00000269143 TTC41PQ6P2S7 1318 aa19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2-201ENST00000269143 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa19.09■□□□□ 0.65
AFG3L2-201ENST00000269143 PHACTR2O75167 634 aa19.08■□□□□ 0.65
AFG3L2-201ENST00000269143 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.65
AFG3L2-201ENST00000269143 FUT8Q9BYC5 575 aa19.08■□□□□ 0.65
AFG3L2-201ENST00000269143 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.65
AFG3L2-201ENST00000269143 KCNQ3O43525 872 aa19.08■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 ADD1P35611 737 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 PPP2R3AQ06190 1150 aa19.08■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 PACS2Q86VP3 889 aa19.08■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 PDE11AQ9HCR9 933 aa19.08■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa19.08■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 PTPRUQ92729 1446 aa19.07■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 FMN2Q9NZ56 1722 aa19.07■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 WWC2Q6AWC2 1192 aa19.07■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 ENGASEQ8NFI3 743 aa19.07■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 RCOR1Q9UKL0 485 aa19.07■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 NDUFA8P51970 172 aa19.07■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 LONRF2Q1L5Z9 754 aa19.07■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 JRKLQ9Y4A0 524 aa19.07■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 MAP3K5Q99683 1374 aa19.07■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 USP6P35125 1406 aa19.07■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 SERPINC1P01008 464 aa19.06■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 TPM1P09493 284 aa19.06■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 SCRN1Q12765 414 aa19.06■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 E2F4Q16254 413 aa19.06■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 CFAP100Q494V2 611 aa19.06■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 EXOC4Q96A65 974 aa19.06■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 USP31Q70CQ4 1352 aa19.06■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 FANCCQ00597 558 aa19.06■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 PDILTQ8N807 584 aa19.06■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 IL17REQ8NFR9 667 aa19.06■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 DPF2Q92785 391 aa19.06■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 CHGBP05060 677 aa19.06■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 CHPF2Q9P2E5 772 aa19.06■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 PLEKHG3A1L390 1219 aa19.05■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa19.05■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 LMOD2Q6P5Q4 547 aa19.05■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 PCDHA7Q9UN72 937 aa19.05■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa19.05■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 KLHDC4Q8TBB5 520 aa19.05■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 SUGCTQ9HAC7 445 aa19.05■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 KIAA1468Q9P260 1216 aa19.05■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 A0A1B0GUL7 405 aa19.04■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 ATP8B1O43520 1251 aa19.04■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 LTKP29376 864 aa19.04■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 GNAT3A8MTJ3 354 aa19.04■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 UBASH3AP57075 661 aa19.04■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 TEX2Q8IWB9 1127 aa19.04■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 NEK1Q96PY6 1258 aa19.04■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 KARSQ15046 597 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa19.04■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 VWA3AA6NCI4 1184 aa19.03■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa19.03■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 TMEM232C9JQI7 657 aa19.03■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 CCP110O43303 1012 aa19.03■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 HDGFP51858 240 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 DHX58Q96C10 678 aa19.03■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 LGR6Q9HBX8 967 aa19.03■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa19.03■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 ARHGEF10O15013 1369 aa19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 DESI2Q9BSY9 194 aa19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 FAN1Q9Y2M0 1017 aa19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 95.5 ms