RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
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UBE2B-201ENST00000265339 BRIP1Q9BX63 1249 aa24.45■■□□□ 1.5
UBE2B-201ENST00000265339 CHRNDQ07001 517 aa24.44■■□□□ 1.5
UBE2B-201ENST00000265339 ATP2B3Q16720 1220 aa24.44■■□□□ 1.5
UBE2B-201ENST00000265339 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
UBE2B-201ENST00000265339 ERC2O15083 957 aa24.43■■□□□ 1.5
UBE2B-201ENST00000265339 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
UBE2B-201ENST00000265339 ARAP2Q8WZ64 1704 aa24.43■■□□□ 1.5
UBE2B-201ENST00000265339 TAF5LO75529 589 aa24.43■■□□□ 1.5
UBE2B-201ENST00000265339 GRAPQ13588 217 aa24.43■■□□□ 1.5
UBE2B-201ENST00000265339 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
UBE2B-201ENST00000265339 SLC16A10Q8TF71 515 aa24.43■■□□□ 1.5
UBE2B-201ENST00000265339 ADORA1P30542 326 aa24.42■■□□□ 1.5
UBE2B-201ENST00000265339 SNX21Q969T3 373 aa24.42■■□□□ 1.5
UBE2B-201ENST00000265339 RAB3GAP1Q15042 981 aa24.42■■□□□ 1.5
UBE2B-201ENST00000265339 XAGE2Q96GT9 111 aa24.41■■□□□ 1.5
UBE2B-201ENST00000265339 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.41■■□□□ 1.5
UBE2B-201ENST00000265339 UQCRHLA0A096LP55 91 aa24.41■■□□□ 1.5
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UBE2B-201ENST00000265339 PTMSP20962 102 aa24.41■■□□□ 1.5
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UBE2B-201ENST00000265339 AK9Q5TCS8 1911 aa24.4■■□□□ 1.5
UBE2B-201ENST00000265339 SNAP23O00161 211 aa24.4■■□□□ 1.5
UBE2B-201ENST00000265339 FGFR2P21802 821 aa24.4■■□□□ 1.5
UBE2B-201ENST00000265339 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa24.4■■□□□ 1.5
UBE2B-201ENST00000265339 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
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UBE2B-201ENST00000265339 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
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UBE2B-201ENST00000265339 PDE6BP35913 854 aa24.39■■□□□ 1.49
UBE2B-201ENST00000265339 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
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UBE2B-201ENST00000265339 RILPL2Q969X0 211 aa24.38■■□□□ 1.49
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UBE2B-201ENST00000265339 SRGNP10124 158 aa24.38■■□□□ 1.49
UBE2B-201ENST00000265339 KIF2CQ99661 725 aa24.38■■□□□ 1.49
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UBE2B-201ENST00000265339 PRDM10Q9NQV6 1147 aa24.37■■□□□ 1.49
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UBE2B-201ENST00000265339 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
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UBE2B-201ENST00000265339 C10orf71Q711Q0 1435 aa24.34■■□□□ 1.49
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC158Q5M9N0 1113 aa24.34■■□□□ 1.49
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UBE2B-201ENST00000265339 UBE4AQ14139 1066 aa24.32■■□□□ 1.48
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UBE2B-201ENST00000265339 MTFR1LQ9H019 292 aa24.32■■□□□ 1.48
UBE2B-201ENST00000265339 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
UBE2B-201ENST00000265339 CACNA1SQ13698 1873 aa24.32■■□□□ 1.48
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UBE2B-201ENST00000265339 CCDC102BQ68D86 513 aa24.31■■□□□ 1.48
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UBE2B-201ENST00000265339 HS1BP3Q53T59 392 aa24.29■■□□□ 1.48
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UBE2B-201ENST00000265339 KIF13BQ9NQT8 1826 aa24.28■■□□□ 1.48
UBE2B-201ENST00000265339 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
UBE2B-201ENST00000265339 KCNJ4P48050 445 aa24.28■■□□□ 1.48
UBE2B-201ENST00000265339 FGD1P98174 961 aa24.28■■□□□ 1.48
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP24.28■■□□□ 1.48
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
UBE2B-201ENST00000265339 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.28■■□□□ 1.48
UBE2B-201ENST00000265339 KLRK1P26718 216 aa24.28■■□□□ 1.48
UBE2B-201ENST00000265339 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
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