RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000034452.11

Ccsap-201, Transcript of Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccsap, Length 2,390 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ccer1Q9CQL2 403 aa26.48■■□□□ 1.83
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Eya2O08575 532 aa26.48■■□□□ 1.83
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cbx1P83917 185 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ints4Q8CIM8 964 aa26.48■■□□□ 1.83
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Naa16Q9DBB4 864 aa26.48■■□□□ 1.83
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Wnk3Q80XP9 1757 aa26.48■■□□□ 1.83
Ccsap-201ENSMUST00000034452 AK157302I3ITR1 129 aa26.47■■□□□ 1.83
Ccsap-201ENSMUST00000034452 LyarQ08288 388 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Zkscan4Q5SZT6 480 aa26.47■■□□□ 1.83
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Isca1Q9D924 129 aa26.47■■□□□ 1.83
Ccsap-201ENSMUST00000034452 FocadA2AKG8 1798 aa26.47■■□□□ 1.83
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Atp2b1G5E829 1220 aa26.47■■□□□ 1.83
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ltv1Q6NSQ7 470 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ube2oQ6ZPJ3 1288 aa26.47■■□□□ 1.83
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Hnrnpul1Q8VDM6 859 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Zscan29E9Q5B4 869 aa26.46■■□□□ 1.83
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Mctp2Q5RJH2 878 aa26.46■■□□□ 1.83
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Tmem67Q8BR76 992 aa26.46■■□□□ 1.83
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Q8BZJ8 459 aa26.46■■□□□ 1.83
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cnpy2Q9QXT0 182 aa26.46■■□□□ 1.83
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Kiaa0753Q6A000 959 aa26.46■■□□□ 1.83
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Arid5bQ8BM75 1188 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ehd4Q9EQP2 541 aa26.46■■□□□ 1.83
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Abca3Q8R420 1704 aa26.45■■□□□ 1.83
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cfap99A0A140LIX9 648 aa26.45■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 RgmbQ7TQ33 436 aa26.45■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Telo2Q9DC40 840 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Tcof1O08784 1320 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Tnnt2P50752 301 aa26.44■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Trim56Q80VI1 734 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Golph3lQ8R088 285 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ciao1Q99KN2 339 aa26.44■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Speer4bQ9D9F7 267 aa26.44■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gm29094F6Q785 221 aa26.44■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ddx17Q501J6 650 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Terf2ipQ91VL8 393 aa26.44■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ppil4Q9CXG3 492 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 MthfsQ9D110 203 aa26.44■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Card6E9PWH2 1175 aa26.43■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Slc4a1P04919 929 aa26.43■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Myd88P22366 296 aa26.43■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 IbspQ61711 324 aa26.43■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Spty2d1Q68FG3 682 aa26.43■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ltb4r2Q9JJL9 360 aa26.43■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cep135Q6P5D4 1140 aa26.43■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Srek1Q8BZX4 494 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Wdr19Q3UGF1 1341 aa26.43■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Nrxn3Q6P9K9 1571 aa26.43■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Mrc1Q61830 1456 aa26.41■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Pald1P70261 859 aa26.41■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ank1Q02357 1862 aa26.41■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 U2af2P26369 475 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ercc3P49135 783 aa26.41■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Alg3Q8K2A8 438 aa26.41■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Fam213aQ9CYH2 218 aa26.41■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 XpcP51612 930 aa26.4■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 TfrcQ62351 763 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 U2af1l4Q8BGJ9 220 aa26.4■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Otud6bQ8K2H2 294 aa26.4■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ppp4r3bQ922R5 820 aa26.4■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 TnksQ6PFX9 1320 aa26.4■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Sall1Q9ER74 1322 aa26.4■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Zpr1Q62384 459 aa26.4■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Fam84aQ9D650 292 aa26.4■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Tulp1Q9Z273 543 aa26.4■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Carmil3Q3UFQ8 1375 aa26.39■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Clic4Q9QYB1 253 aa26.39■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Col4a1P02463 1669 aa26.39■■□□□ 1.82
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ap5z1Q3U829 807 aa26.39■■□□□ 1.81
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Zfp397Q7TNK4 527 aa26.39■■□□□ 1.81
Ccsap-201ENSMUST00000034452 AbraQ8BUZ1 375 aa26.39■■□□□ 1.81
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Mei1Q9D4I2 1268 aa26.39■■□□□ 1.81
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Plekhd1B2RPU2 505 aa26.38■■□□□ 1.81
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Vmn2r23E9PXI5 849 aa26.38■■□□□ 1.81
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Shisa4Q8CA71 197 aa26.38■■□□□ 1.81
Ccsap-201ENSMUST00000034452 SdsQ8VBT2 327 aa26.38■■□□□ 1.81
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Dhx30Q99PU8 1217 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cdc45Q9Z1X9 566 aa26.38■■□□□ 1.81
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Hand2Q61039 217 aa26.38■■□□□ 1.81
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Stk38Q91VJ4 465 aa26.38■■□□□ 1.81
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cyp3a57D3YYZ0 503 aa26.37■■□□□ 1.81
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Anks1aP59672 1150 aa26.37■■□□□ 1.81
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Tmem59lQ7TNI2 337 aa26.37■■□□□ 1.81
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ints5Q8CHT3 1018 aa26.37■■□□□ 1.81
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Abca15E9PWH4 1668 aa26.37■■□□□ 1.81
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Nop2Q922K7 793 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Yeats4Q9CR11 227 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Atf3Q60765 181 aa26.36■■□□□ 1.81
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Pramel3A2AHA7 463 aa26.35■■□□□ 1.81
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gm7903A2AWL1 463 aa26.35■■□□□ 1.81
Ccsap-201ENSMUST00000034452 AV320801A2AWL3 467 aa26.35■■□□□ 1.81
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gm15023L7MUB4 467 aa26.35■■□□□ 1.81
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Nfatc2ipO09130 412 aa26.35■■□□□ 1.81
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Taf3Q5HZG4 932 aa26.35■■□□□ 1.81
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Frat1P70339 274 aa26.35■■□□□ 1.81
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cep55Q8BT07 462 aa26.35■■□□□ 1.81
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Tmem87aQ8BXN9 555 aa26.35■■□□□ 1.81
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ttc19Q8CC21 365 aa26.35■■□□□ 1.81
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Hps3Q91VB4 1002 aa26.35■■□□□ 1.81
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Creld2Q9CYA0 350 aa26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.6 ms