RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561524.5

KIFC3-208, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 577 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-208	ENST00000561524	HAX1	O00165	279 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	LGALS8	O00214	317 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	FKBP6	O75344	327 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	TIPRL	O75663	272 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	POU1F1	P28069	291 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	SPATA24	Q86W54	205 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	OTULIN	Q96BN8	352 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	NIPAL2	Q9H841	368 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	ESM1	Q9NQ30	184 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF69	Q9UC07	566 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		13.89	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	TBX1	O43435	398 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	LHB	P01229	141 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	LIPF	P07098	398 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	LYN	P07948	512 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	H2BFM	P0C1H6	154 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	BPIFB3	P59826	476 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	ACTG1	P63261	375 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	CD276	Q5ZPR3	534 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	SPATC1	Q76KD6	591 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	CPO	Q8IVL8	374 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	FTMT	Q8N4E7	242 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	REEP6	Q96HR9	211 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	OR10A2	Q9H208	303 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		13.88	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	OOEP	A6NGQ2	149 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	GSC2	O15499	205 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	PLAT	P00750	562 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	PRKACG	P22612	351 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	SLC2A5	P22732	501 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	CFHR2	P36980	270 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	OR8B8	Q15620	311 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	FAM57B	Q71RH2	274 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	PARP8	Q8N3A8	854 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	OR8S1	Q8NH09	359 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	AMELY	Q99218	206 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	ABCB9	Q9NP78	766 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		13.87	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	GRP	P07492	148 aa		13.86	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	PRTN3	P24158	256 aa		13.86	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	CFP	P27918	469 aa		13.86	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	MTNR1A	P48039	350 aa		13.86	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	GSK3A	P49840	483 aa		13.86	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	BNIP1	Q12981	228 aa		13.86	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	KLHL12	Q53G59	568 aa		13.86	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	FAHD1	Q6P587	224 aa		13.86	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	KRT74	Q7RTS7	529 aa		13.86	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	THEM6	Q8WUY1	208 aa		13.86	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	PGAM5	Q96HS1	289 aa		13.86	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		13.86	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		13.86	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		13.86	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	ACOD1	A6NK06	481 aa		13.85	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524		A6NLC8	198 aa		13.85	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	CLDN34	H7C241	214 aa		13.85	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	ALOX5AP	P20292	161 aa		13.85	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	RASSF2	P50749	326 aa		13.85	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	CRISP1	P54107	249 aa		13.85	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	ESRRG	P62508	458 aa		13.85	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		13.85	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		13.85	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		13.85	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		13.85	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		13.85	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		13.85	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	TEAD3	Q99594	435 aa		13.85	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		13.85	□□□□□ -0.19

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.3 ms