RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MESTQ5EB52 335 aa13.41□□□□□ -0.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DLEU7Q6UYE1 221 aa13.41□□□□□ -0.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RNF144BQ7Z419 303 aa13.41□□□□□ -0.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAVSQ7Z434 540 aa13.41□□□□□ -0.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM216BQ8N7L0 139 aa13.41□□□□□ -0.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM156AQ8NDB6 213 aa13.41□□□□□ -0.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C17orf50Q8WW18 174 aa13.41□□□□□ -0.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF570Q96NI8 536 aa13.41□□□□□ -0.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NDEL1Q9GZM8 345 aa13.41□□□□□ -0.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRSS22Q9GZN4 317 aa13.41□□□□□ -0.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DUX4Q9UBX2 424 aa13.41□□□□□ -0.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NDUFAF1Q9Y375 327 aa13.41□□□□□ -0.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TENM2Q9NT68 2774 aa13.4□□□□□ -0.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 F5H5K5 113 aa13.4□□□□□ -0.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ALDOBP05062 364 aa13.4□□□□□ -0.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IFNA8P32881 189 aa13.4□□□□□ -0.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TGM4P49221 684 aa13.4□□□□□ -0.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BMXP51813 675 aa13.4□□□□□ -0.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CD83Q01151 205 aa13.4□□□□□ -0.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ST3GAL3Q11203 375 aa13.4□□□□□ -0.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FHL1Q13642 323 aa13.4□□□□□ -0.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa13.4□□□□□ -0.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRT71Q3SY84 523 aa13.4□□□□□ -0.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MICU2Q8IYU8 434 aa13.4□□□□□ -0.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AJUBAQ96IF1 538 aa13.4□□□□□ -0.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 Q96M85 177 aa13.4□□□□□ -0.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SYT4Q9H2B2 425 aa13.4□□□□□ -0.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa13.4□□□□□ -0.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LHFPL6Q9Y693 200 aa13.4□□□□□ -0.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RYR2Q92736 4967 aa13.4□□□□□ -0.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A1W2PQ09 198 aa13.39□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MEGF11A6BM72 1044 aa13.39□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GGT3PA6NGU5 568 aa13.39□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EFCAB9A8MZ26 197 aa13.39□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZFPL1O95159 310 aa13.39□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LMO1P25800 156 aa13.39□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GGT2P36268 569 aa13.39□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RABL3Q5HYI8 236 aa13.39□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CASC10Q5T4H9 136 aa13.39□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC80Q76M96 950 aa13.39□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PIFOQ8TCI5 191 aa13.39□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LRRC29Q8WV35 223 aa13.39□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DNTTIP1Q9H147 329 aa13.39□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BHLHE40O14503 412 aa13.38□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ACOT8O14734 319 aa13.38□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANGPTL7O43827 346 aa13.38□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CRYBA2P53672 197 aa13.38□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MTPNP58546 118 aa13.38□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM122BQ7Z309 247 aa13.38□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa13.38□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR5M11Q96RB7 305 aa13.38□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PITX2Q99697 317 aa13.38□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATF6BQ99941 703 aa13.38□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CAPN7Q9Y6W3 813 aa13.38□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa13.37□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VGLL3A8MV65 326 aa13.37□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 H0YAE9 185 aa13.37□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GLCEO94923 617 aa13.37□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TNFRSF1BP20333 461 aa13.37□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SDHAP31040 664 aa13.37□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TPTEP56180 551 aa13.37□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRKCDQ05655 676 aa13.37□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VMACQ2NL98 169 aa13.37□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPR139Q6DWJ6 353 aa13.37□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HCP5Q6MZN7 132 aa13.37□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DNM1P34Q6PK57 102 aa13.37□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CORO6Q6QEF8 472 aa13.37□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EPGNQ6UW88 154 aa13.37□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DHDDSQ86SQ9 333 aa13.37□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADCK1Q86TW2 530 aa13.37□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NAA40Q86UY6 237 aa13.37□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NRMQ8IXM6 262 aa13.37□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR5AU1Q8NGC0 362 aa13.37□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR13C2Q8NGS9 318 aa13.37□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MUC7Q8TAX7 377 aa13.37□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MED30Q96HR3 178 aa13.37□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CGREF1Q99674 301 aa13.37□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHID1Q9BWS9 393 aa13.37□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NUAK2Q9H093 628 aa13.37□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PITPNC1Q9UKF7 332 aa13.37□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NKX6-3A6NJ46 265 aa13.36□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 F2RL2O00254 374 aa13.36□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POU1F1P28069 291 aa13.36□□□□□ -0.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CRABP1P29762 137 aa13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms