RNA–Protein interactions for RNA: YOR109W

INP53, Transcript of Polyphosphatidylinositol phosphatase, yeast

Gene INP53, Length 3,324 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
INP53	YOR109W	NEO1	P40527	1151 aa		2.76	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	SAP185	P40856	1058 aa		2.76	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	TAD1	P53065	400 aa		2.76	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	VPS30	Q02948	557 aa		2.76	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	RRI2	Q12348	645 aa		2.76	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		2.76	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	ADE8	P04161	214 aa		2.76	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	NPP1	P25353	742 aa		2.76	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	NFS1	P25374	497 aa		2.76	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	PRD1	P25375	712 aa		2.76	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	BEM3	P32873	1128 aa		2.76	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	MXR1	P40029	184 aa		2.76	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	BNA1	P47096	177 aa		2.76	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	GYP7	P48365	746 aa		2.76	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	YDR338C	Q05497	695 aa		2.76	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	REH1	Q06709	432 aa		2.76	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	MET7	Q08645	548 aa		2.76	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	YDR056C	Q12025	205 aa		2.76	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	GNT1	Q12096	491 aa		2.76	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	FPS1	P23900	669 aa		2.75	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	BIT2	P38346	545 aa		2.75	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	IML2	P47031	731 aa		2.75	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	LCD1	Q04377	747 aa		2.75	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	THI72	Q08579	599 aa		2.75	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	GUP2	Q08929	609 aa		2.75	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	KRE2	P27809	442 aa		2.75	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	CHS3	P29465	1165 aa		2.75	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	ICP55	P40051	511 aa		2.75	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	GTR1	Q00582	310 aa		2.75	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	RSC2	Q06488	889 aa		2.75	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	PSR2	Q07949	397 aa		2.75	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	ENA1	P13587	1091 aa		2.75	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	AFR1	P33304	620 aa		2.75	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	MCD4	P36051	919 aa		2.75	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	RGD1	P38339	666 aa		2.75	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	CAF16	P43569	289 aa		2.75	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	NPY1	P53164	384 aa		2.75	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	ENA2	Q01896	1091 aa		2.75	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	ENA5	Q12691	1091 aa		2.75	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	SWI1	P09547	1314 aa		2.75	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	COQ4	O13525	335 aa		2.74	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	OPI1	P21957	404 aa		2.74	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	TFC3	P34111	1160 aa		2.74	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	TDA3	P38758	523 aa		2.74	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	PNT1	P38969	423 aa		2.74	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	SIT1	P39980	628 aa		2.74	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	QRI7	P43122	407 aa		2.74	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	YFL066C	P43538	392 aa		2.74	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	NSG2	P53898	299 aa		2.74	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	ECM9	Q02202	377 aa		2.74	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	YHM2	Q04013	314 aa		2.74	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	YMR018W	Q04364	514 aa		2.74	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	YPR027C	Q12079	277 aa		2.74	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	HOG1	P32485	435 aa		2.74	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	TOA1	P32773	286 aa		2.74	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	REC104	P33323	182 aa		2.74	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	GPB2	P39717	880 aa		2.74	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	CSR2	Q12734	1121 aa		2.74	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	AI1	P03875	834 aa		2.73	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	PHO81	P17442	1178 aa		2.73	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	YEL1	P34225	687 aa		2.73	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	MAC1	P35192	417 aa		2.73	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	ACA1	P39970	489 aa		2.73	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	HRQ1	Q05549	1077 aa		2.73	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	HIF1	Q12373	385 aa		2.73	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	MSS18	P08593	268 aa		2.73	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	DAL5	P15365	543 aa		2.73	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	SLD3	P53135	668 aa		2.73	□□□□□ -1.97
INP53	YOR109W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97

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