RNA–Protein interactions for RNA: YOL093W

TRM10, Transcript of tRNA methyltransferase, yeast

Gene TRM10, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRM10	YOL093W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.42	□□□□□ -1.54	not detected
TRM10	YOL093W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	YER130C	P39959	443 aa		5.42	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	NET1	P47035	1189 aa		5.42	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	YPT11	P48559	417 aa		5.42	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	FMS1	P50264	508 aa		5.42	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	LCD1	Q04377	747 aa		5.42	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	SGD1	Q06132	899 aa		5.42	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	MMR1	Q06324	491 aa		5.42	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	DCS2	Q12123	353 aa		5.42	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	RKM4	Q12504	494 aa		5.42	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	SUL1	P38359	859 aa		5.41	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	NPR3	P38742	1146 aa		5.41	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	PEX7	P39108	375 aa		5.41	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	GPB2	P39717	880 aa		5.41	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	LIF1	P53150	421 aa		5.41	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	EAR1	Q03212	550 aa		5.41	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	RBA50	Q04418	439 aa		5.41	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	TY3A-G	Q12173	290 aa		5.41	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	SMC6	Q12749	1114 aa		5.41	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	TY3A-I	Q99219	290 aa		5.41	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	RAD18	P10862	487 aa		5.4	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	CKA2	P19454	339 aa		5.4	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	CTS1	P29029	562 aa		5.4	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	MIC60	P36112	540 aa		5.4	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	MRPL10	P36520	322 aa		5.4	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	RKM3	P38222	552 aa		5.4	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	YGR153W	P48238	217 aa		5.4	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	ASE1	P50275	885 aa		5.4	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	YGR125W	P53273	1036 aa		5.4	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	AIM33	Q04516	312 aa		5.4	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	SVF1	Q05515	481 aa		5.4	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	GUD1	Q07729	489 aa		5.4	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	AVO1	Q08236	1176 aa		5.4	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	YPL277C	Q08989	487 aa		5.4	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	ECM29	P38737	1868 aa		5.4	□□□□□ -1.55
TRM10	YOL093W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
TRM10	YOL093W	CDC15	P27636	974 aa		5.39	□□□□□ -1.55
TRM10	YOL093W	MET4	P32389	672 aa		5.39	□□□□□ -1.55
TRM10	YOL093W	EUG1	P32474	517 aa		5.39	□□□□□ -1.55
TRM10	YOL093W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
TRM10	YOL093W	GAA1	P39012	614 aa		5.39	□□□□□ -1.55
TRM10	YOL093W	DAK2	P43550	591 aa		5.39	□□□□□ -1.55
TRM10	YOL093W	VPS53	P47061	822 aa		5.39	□□□□□ -1.55
TRM10	YOL093W	ALT1	P52893	592 aa		5.39	□□□□□ -1.55
TRM10	YOL093W	RSC1	P53236	928 aa		5.39	□□□□□ -1.55
TRM10	YOL093W	CBK1	P53894	756 aa		5.39	□□□□□ -1.55
TRM10	YOL093W	YML122C	Q03207	126 aa		5.39	□□□□□ -1.55
TRM10	YOL093W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
TRM10	YOL093W	SPH1	Q06160	661 aa		5.39	□□□□□ -1.55
TRM10	YOL093W	SUE1	Q06524	206 aa		5.39	□□□□□ -1.55
TRM10	YOL093W	UBX5	Q06682	500 aa		5.39	□□□□□ -1.55
TRM10	YOL093W	PSR2	Q07949	397 aa		5.39	□□□□□ -1.55
TRM10	YOL093W	GPA1	P08539	472 aa		5.38	□□□□□ -1.55
TRM10	YOL093W	FBP1	P09201	348 aa		5.38	□□□□□ -1.55
TRM10	YOL093W	SEC8	P32855	1065 aa		5.38	□□□□□ -1.55
TRM10	YOL093W	SQT1	P35184	431 aa		5.38	□□□□□ -1.55
TRM10	YOL093W	ATG14	P38270	344 aa		5.38	□□□□□ -1.55
TRM10	YOL093W	ERG7	P38604	731 aa		5.38	□□□□□ -1.55
TRM10	YOL093W	PNT1	P38969	423 aa		5.38	□□□□□ -1.55
TRM10	YOL093W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
TRM10	YOL093W	VTC2	P43585	828 aa		5.38	□□□□□ -1.55
TRM10	YOL093W	UBA2	P52488	636 aa		5.38	□□□□□ -1.55
TRM10	YOL093W	SEC5	P89102	971 aa		5.38	□□□□□ -1.55
TRM10	YOL093W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
TRM10	YOL093W	DAL4	Q04895	635 aa		5.38	□□□□□ -1.55
TRM10	YOL093W	YVC1	Q12324	675 aa		5.38	□□□□□ -1.55
TRM10	YOL093W	PTC5	Q12511	572 aa		5.38	□□□□□ -1.55
TRM10	YOL093W	FOB1	O13329	566 aa		5.37	□□□□□ -1.55
TRM10	YOL093W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
TRM10	YOL093W	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
TRM10	YOL093W	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		5.37	□□□□□ -1.55
TRM10	YOL093W	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		5.37	□□□□□ -1.55

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