RNA–Protein interactions for RNA: YJL038C

LOH1, Transcript of Protein involved in outer spore wall assembly, yeast

Gene LOH1, Length 660 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LOH1	YJL038C	SSL2	Q00578	843 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
LOH1	YJL038C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	SVS1	Q12254	260 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
LOH1	YJL038C	PET112	P33893	541 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	MEF2	P39677	819 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	MPH1	P40562	993 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	GSM1	P42950	618 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	GSC2	P40989	1895 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	YLR358C	O13565	187 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	CMP2	P14747	604 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	BAS1	P22035	811 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	APL1	P27351	700 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	UGA2	P38067	497 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	NPR3	P38742	1146 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	MXR1	P40029	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	ATG36	P46983	293 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	ERO1	Q03103	563 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	VPS72	Q03388	795 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	GAL10	P04397	699 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	GPA1	P08539	472 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	SNF3	P10870	884 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	ANP1	P32629	500 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	YER130C	P39959	443 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	EAF6	P47128	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	GCN5	Q03330	439 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	PLB2	Q03674	706 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	TFC6	Q06339	672 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LOH1	YJL038C	CDC6	P09119	513 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	SWE1	P32944	819 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	MYO3	P36006	1272 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	MIC60	P36112	540 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	ERT1	P38140	529 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	RTS1	P38903	757 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	CSM2	P40465	213 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	YPT11	P48559	417 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	PIP2	P52960	996 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
LOH1	YJL038C	GNT1	Q12096	491 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	DCS2	Q12123	353 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	FLO1	P32768	1537 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	CBP3	P21560	335 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	RIT1	P23796	513 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	VID27	P40157	782 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	YDR132C	Q03900	495 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	UBX2	Q04228	584 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	PSF3	Q12146	194 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	RAD61	Q99359	647 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	MYO1	P08964	1928 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	CDC34	P14682	295 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
LOH1	YJL038C	SRM1	P21827	482 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	MAK31	P23059	88 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	GSY2	P27472	705 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	LYP1	P32487	611 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	YKU70	P32807	602 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	MRPL10	P36520	322 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	MAL31	P38156	614 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	PCI8	P40512	444 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	TYW3	P53177	273 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	KIN4	Q01919	800 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	ACM1	Q08981	209 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	YOR111W	Q99210	232 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	INO1	P11986	533 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	ACE2	P21192	770 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	PPG1	P32838	368 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.8 ms