RNA–Protein interactions for RNA: YHR128W

FUR1, Transcript of Uracil phosphoribosyltransferase, yeast

Gene FUR1, Length 651 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FUR1	YHR128W	RTT10	Q08924	1013 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	ECM29	P38737	1868 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	PRE8	P23639	250 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	DOM34	P33309	386 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	OCT1	P35999	772 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	MXR1	P40029	184 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	NET1	P47035	1189 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	SKG3	Q06315	1026 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	RXT3	Q07458	294 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	TAH18	Q12181	623 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	OPI1	P21957	404 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	CDC20	P26309	610 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	CHS3	P29465	1165 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	CST26	P38226	397 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	ERG7	P38604	731 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	RTS1	P38903	757 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	VID27	P40157	782 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	HDA1	P53973	706 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	GPB1	Q08886	897 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	RIM20	Q12033	661 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	GNT1	Q12096	491 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	TAO3	P40468	2376 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	ACE2	P21192	770 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	UBX5	Q06682	500 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	RAD61	Q99359	647 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	TUS1	Q06412	1307 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	MYO3	P36006	1272 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	LYS14	P40971	790 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	YML037C	Q03703	340 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	SIZ1	Q04195	904 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	TMA10	Q06177	86 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	MYO1	P08964	1928 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	BI4	P03879	638 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	CDC6	P09119	513 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	LST4	P34239	828 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	MCD4	P36051	919 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	BRN1	P38170	754 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	VAB2	P40003	282 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	YAP6	Q03935	383 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	ACM1	Q08981	209 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	RAD50	P12753	1312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	PER1	P25625	357 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	ANP1	P32629	500 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	GEM1	P39722	662 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	GCV2	P49095	1034 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	MSC2	Q03455	724 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FUR1	YHR128W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FUR1	YHR128W	RAD18	P10862	487 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUR1	YHR128W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FUR1	YHR128W	RIT1	P23796	513 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUR1	YHR128W	EMC1	P25574	760 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUR1	YHR128W	LYP1	P32487	611 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUR1	YHR128W	DUT1	P33317	147 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUR1	YHR128W	SLA2	P33338	968 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUR1	YHR128W	TRM2	P33753	639 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUR1	YHR128W	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FUR1	YHR128W	VPS8	P39702	1274 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUR1	YHR128W	PSF2	P40359	213 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUR1	YHR128W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FUR1	YHR128W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FUR1	YHR128W	VPS62	P53285	467 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUR1	YHR128W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FUR1	YHR128W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FUR1	YHR128W	SUE1	Q06524	206 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUR1	YHR128W	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUR1	YHR128W	PNS1	Q12412	539 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUR1	YHR128W	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUR1	YHR128W	NUC1	P08466	329 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FUR1	YHR128W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FUR1	YHR128W	STE11	P23561	717 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FUR1	YHR128W	HCM1	P25364	564 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FUR1	YHR128W	EUG1	P32474	517 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FUR1	YHR128W	PET112	P33893	541 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FUR1	YHR128W	TGL1	P34163	548 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FUR1	YHR128W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
FUR1	YHR128W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
FUR1	YHR128W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68

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